Characterization of imprinted genes in barley with a focus on maternally expressed factor LYS3
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM2024LU004
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
---
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace imprintovaných genů ječmene se zaměřením na maternálně exprimovaný faktor LYS3
Annotation in Czech
Cílem předkládaného projektu je přispět k pochopení funkce genomického imprintingu ve vývoji semen obilovin. Tento epigenetický mechanismus vede k mateřské nebo otcovské uniparentální expresi specifických genů, které zajišťují zdárný vývoj semene. Navrhovaný projekt se skládá ze dvou na sebe navazujících etap (E), které jsou logicky rozděleny do jednotlivých milníků (M) zahrnujících ucelené experimentální celky. Výsledky budou sloužit jako případová studie ohledně role genomického imprintingu na vývoj semen obilovin. U obilovin jako ječmen nebo pšenice, typických pro zemědělskou produkci v České republice, dosud nebyla takováto studie realizována. Dílčí cíle projektu zahrnují: - Charakterizaci seznamu 261 maternálně a paternálně imprintovaných genů v endospermu ječmene pomocí genomických dat pro ječmen a ostatní obiloviny. - Genetickou charakterizaci LYS3 jako nově objeveného maternálně exprimovaného (paternálně imprintovaného) genu u ječmene setého a pšenice seté. - Monitoring exprese LYS3 v pletivech vyvíjejícího se semene, což umožní posouzení dynamiky exprese z jednotlivých rodičovských alel a zhodnocení případného přepnutí z imprintovaného do neimprintovaného režimu. - Nalezení genů, které přímo podléhají regulaci transkripčním faktorem LYS3.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Sep 1, 2024
Realization period - end
Sep 30, 2027
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 24, 2025
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-LU-R
Data delivery date
Mar 7, 2025
Finance
Total approved costs
4,817 thou. CZK
Public financial support
4,817 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK