UP - Popelková
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Support of incipient R&D workers
Call for proposals
Program podpory začínajících pracovníků výzkumu a vývoje (LZ) (SMSM200300001)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Domény aminokyselinové sekvence rostlinné cytokin dehydrogenázy odpovědné za substrátovou specifitu a funkční konformaci proteinu
Annotation in Czech
Předmětem řešení předkládaného projektu je flavoenzym cytokinin oxidáza/dehydrogenáza, který katalyzuje odbourávání cytokininových hormonů N6-(2-isopentenyl)adeninu a zeatinu, a reguluje tak jejich metabolismus v rostlinách.V genomu modelové rostliny Arabidopsis thaliana je tento flavoprotein kódován celkem sedmi geny. Jeden z těchto genů, AtCKX2, byl již naklonován a exprimován v systému kvasinek Saccharomyces cerevisae 23344 jako AtCKX2 protein.Cílem tohoto projektu je mutageneze AtCKX2 genu ve snazevytvořit mutantní AtCKX2 proteiny. Půjde o nalezení domén či konkrétních residuí v aminokyselinové sekvenci AtCKX2, které jsou důležité pro substrátovou specifitu a funkční strukturu.Při hledání těchto domén se budeme opírat o molekulové modelování a sekvenční srovnávání založené na homologii aminokyselinové sekvence AtCKX2 s D-laktát dehydrogenázou, případně dalšímí flavoenzymy se známou funkční strukturou.
Scientific branches
R&D category
IF - RDI infrastructure
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Homological model of the cytokinin oxidase/dehydrogenase (CKX) was created, intermediates of CKX catalytic reaction were identified and characterized, and 9 mutated yeast strains overexpressing CKX were produced.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MSM-LZ-U/04:2
Data delivery date
May 29, 2008
Finance
Total approved costs
2,004 thou. CZK
Public financial support
1,376 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
628 thou. CZK