The analysis of molecular organization of the retrovirus particle and interactions leading to its assembly
Project goals
The aim is to employ a multi-methodical approach to study various aspects of formation of retroviral particles. This will be made possible by the employment of complementary highly specialized methods that are established exclusively in the collaboratinglaboratories. The in vitro assembly method of virus like particles and study of their molecular organization, intracellular transport and interactions with cellular proteins will be interlinked with the research in the collaborating US laboratories (thelaboratory of prof. Hunter resides in a multi-methodical approach to the study of the mechanism of capsid formation, the laboratory of prof. McPherson analyzes viral particles by AFM (atomic force microscopy) on the structural studies. The organizationof phenotypically interesting retroviral mutants that are studied in the laboratory of PI will be compared in collaboration with the laboratory of prof. Barklis that is focused on the assembly of virus particles on artificial lipid membranes.
Keywords
retroviral particlesvirusesretroviral mutantsvirus particlescapsid formation
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
KONTAKT 5 (SMSM2007ME2)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
1322/2010-32
Alternative language
Project name in Czech
Analýza molekulárního uspořádání retrovirové částice a interakcí vedoucích k jejímu vzniku
Annotation in Czech
Cílem je objasnit uspořádání retrovirových proteinů v kapsidě využitím metodických přístupů a vybavení vysoce specializovaných pracovišť zaměřených na různé aspekty mechanismů skládání retrovirových částic. Intenzivní přenos technologií mezi laboratořemiformou krátkodobých návštěv pracovníků ze skupiny navrhovatele v laboratořích USA. Propojení metody přípravy retrovirům podobných částic in vitro a studia problematiky molekulárního uspořádání částic, jejich intracelulárního transportu a interakce s buněčnými proteiny s výzkumem řešeným ve spolupracujících laboratořích v USA: laboratoří prof. Huntera a jeho multimetodickém přístupu ke studiu mechanismu tvorby kapsid, laboratoří prof. McPhersona, ojedinělým pracovištěm analyzujícím virové částice pomocíAFM (atomic force microscopy) a laboratoří prof. Barklise, která se jako jediná na světě zabývá skládáním virových částic na umělých lipidových membránách, kde bude porovnána organizace fenotypově zajímavých mutantů retrovirů, jež máme k dispozici..
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
M-PMV protein precursors are transported by dynein molecular motor. M-PMV matrix protein (MA) trimerizes better than HIV MA. Basic domain of nucleocapsid protein is essential for virus assembly. Molar ratio of synthetized retroviral polyproteins does notcorrespond with their ratio in immature particle. Glycine rich domain is part of reverse transcriptase and is important for infectivity.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 14, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jul 12, 2012
Finance
Total approved costs
2,391 thou. CZK
Public financial support
2,391 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 391 CZK thou.
Public support
2 391 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
CEP
EE - Microbiology, virology
Solution period
01. 05. 2007 - 31. 12. 2011