Mapping of common fragile sites in the human genome

Project name in Czech
Mapování fragilních míst v lidském genomu
Annotation in Czech
Experimentálně pozorovanou anomálii v dohasínání luminiscence u některých dopovaných alkalických halogenidů jsme před časem vysvětlili jako důsledek pomalé relaxace mříže. Výrazné zpomalení relaxace mříže spojujeme se vznikem solitonu Fermi-Pasta-Ulam-ova typu, který se v moderní literatuře v podobném kontextu označuje pojmem diskrétní breather. V této práci chceme pokračovat. V experimentální oblasti studiem limitů pozorované dosvitové anomálie a rozšířením třídy studovaných příměsí. V případě smíšených krystalů KCl-xBrx:Pb2+ se ukázalo, že 10%-ní a vyšší přítomnost Cl vymaže anomálii. Již studované příměsi Tl+ a Pb2+ bychom chtěli rozšířit o In+ (lehčí než Tl+) a Br3+ (studium vlivu kompenzační vakance). Experimentální výsledky uvedeme do souvislostis breatherovým modelem. Chceme se pokusit o přímou experimentální detekci breatheru Ramanovou spektroskopií. V teoretické oblasti budeme studovat vlastnosti breatheru ? hlavně vliv šumu na rozpad breatheru a vliv počtu frekvencí na rozpad breatheru.

R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BE - Theoretical physics
CEP - secondary branch
BM - Solid-state physics and magnetism
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10301 - Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)<br>10302 - Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.)

Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We aim to know more about structure, function and epigenetic processes in human genome. We found that important proteins, including BMI1, HP1? and OCT4, recruit to UV-damaged chromatin. We also summarized literary data on fragile sites in the article ?Genome instability in the context of chromatin structure and fragile sites?. Thus, we provided a complex view on this field of science.

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jul 12, 2012

Project goals