Phospholipase D regulated transcriptome of systemic acquired resistence in Arabidopsis thaliana
Project goals
Project is focused on the study of phospholipid signalling in the processes leading to systemic acquired resistance, which is one of the mechanisms of plant response to pathogene attack. Basic characteristic of SAR is the early accumulation of salicylicacid (SA), both in the site of infection and in distal plant tisues. SA triggers a complex cascade of signaling events resulting in the expression of PR proteins. The aim of the project is to analyze the transcriptome in the cells of Arabidopsis thalianasuspension culture treated with SA and n-butanol (potent inhibitor of PLD) and thus reveal the group of genes dependent the activity of PLD, which is one of the key enzymes of phospholipid metabolism in plants. It seems very likely that this group willbe mostly identical with those regulated by phosphatidylinositol 4-kinase, the enzyme producing phosphatidylinositol 4,5-bisphospahate, an activator of PLD. It would implicated the close connection of both enzymes in SA pathway in Arabidopsis thaliana.
Keywords
Phospholipase DtranscriptomeArabidopsis thalianaphospholipid signallingphospholipid metabolism
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
KONTAKT 5 (SMSM2007ME2)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
8 424/2007-32
Alternative language
Project name in Czech
Úloha fosfolipasy D při regulaci transkriptomu systémové získané resistence u Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na studium úlohy rostlinného fosfolipidového signálního systému v procesech vedoucích ke spuštění systémové získané resistence (SAR), jednoho z mechanismů jímž rostliny reagují na napadení patogenem. Základním projevem SAR je akumulacekyseliny salicylové (SA) a to i v nenapadených částech rostlin vedoucí ke spuštění exprese obranných genů (PR-geny). Cílem projektu je nalézt pomocí analýzy DNA chipů v buňkách suspensní kultury Arabidopsis thaliana ošetřených SA a n-butanolem (inhibitor PLD) skupinu genů závislých na aktivitě fosfolipasy D (PLD), jednoho z klíčových enzymů metabolismu fosfolipidů u rostlin. Je pravděpodobné, že tato skupina genů bude z velké části shodná se skupinou genů závislých na aktivitě fosfatidylinositol 4 kinasy, jejíž produkt fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát je aktivátorem PLD. To by ukazovalo na těsné spojení funkce obou enzymů v signální dráze odpovědi na SA v Arabidopsis thaliana. Dále bude možné identifikovat dosud nepopsané SA-indukované geny.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Transcriptome analysis of A.thaliana culture cells treated with salicylic acid revealed significant group of genes regulated by phospholipase D.Investigation of T DNA insertion lines of A.thaliana plants showed involvment of dist.isoforms of this enzyme
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 29, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-MSM-ME-U/02:2
Data delivery date
May 7, 2010
Finance
Total approved costs
381 thou. CZK
Public financial support
381 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
381 CZK thou.
Public support
381 CZK thou.
0%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
CEP
CE - Biochemistry
Solution period
01. 05. 2007 - 31. 12. 2008