Metagenomic approaches for studying of microbial diversity at environmentally stressed conditions
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
KONTAKT 8 (SMSM2010ME5)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
2062/2011-320
Alternative language
Project name in Czech
Využití metagenomických přístupů pro studium mikrobiální diversity a jejich změn v podmínkách environmentálního stresu
Annotation in Czech
Cílem je využití metagenomiky pro charakterizaci klíčových faktorů, které určují mikrobiální a funkční diversitu populací dominujících v prostředí a nalezení vazeb mezi změnami systému v souvislosti s působením biotických a abiotických vlivů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Methods for analyzing pyrosequencing data have been optimized in the frame of the project. These are suitable for the studies of taxonomic and metabolic diversity of environmental bacteria. Using this methodology along with contaminant concentration assays we found out that biostimulation of certain indigenous microbiota can result in increased degradation rates of PCBs.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 16, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
1,655 thou. CZK
Public financial support
1,655 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK