Heterogeneous Data Fusion for Genomic and Proteomic Data Mining
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
—
Main participants
—
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
6094/2009-32
Alternative language
Project name in Czech
Fúze heterogenních dat pro dolování genomických a proteomických znalostí
Annotation in Czech
V současné post-genomické éře objevujeme funkci a vlastnosti genů, stejně tak jako jejich vzájemné vztahy, na základě velkého počtu experimentů. Tyto experimenty mají na svém výstupu značné objemy různorodých dat, které je pro úspěšné získání nových znalostí nutné dále kombinovat se znalostmi stávajícími - s abstrakty vědeckých textů, ontologickými anotacemi nebo údaji o metabolických stezkách. Z vědeckého hlediska se jako velmi zajímavá jeví formalizace výše naznačené informační fúze, tj. automatická integrace informací z rozdílných zdrojů a s rozdílnou reprezentací, věrohodností a úrovni abstrakce. Výsledkem je návrh informačního toku posloupností dedikovaných algoritmů. Tento tok je navržen tak, aby bylo dosaženo optimálních hypotéz či rozhodnutí. Cíle projektu dělíme do tří kategorií: 1) kolaborační: sjednocení a sdílení konkrétních algoritmů a postupů aplikovatelných na různé typy biologických dat zvládnutých jednotlivými projektovými partnery, hlavní pozornost bude věnována induktivnímu logick
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
IN - Informatics
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We reached our scientific goals. The joint papers (2009): InderScience journal paper, two IGI Global book chapters. Ongoing cooperation: PhD students Buryan and Poezevara prepare a conference paper on graph mining, master student Vitovec has a shared thesis topic, prof. Cremilleux will review the PhD thesis of Filip Karel submitted in August, a paper was submitted to LREC 2010.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2010
Finance
Total approved costs
85 thou. CZK
Public financial support
85 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK