Molecular genetic typing of Steptococcus pyogenes strains: emm typing
Project goals
The NRL for Streptococci and Enterococci, the only laboratory skilled in S. pyogenes typing in the Czech Republic, intends to implement the genotyping method - emm typing to replace the labour- intensive and much less effective standard serotyping methodThis method will be suitable for genotype monitoring as a prerequisite for development of the new generation of type specific vaccine. This method will allow unambiguous identification of identical or diverse isolates. Emm typing will provide results comparable at an international level.
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Infection diseases, microbiology, epidemiology a immunology
Call for proposals
Infekční choroby, mikrobiologie, epidemiologie a imunologie 2 (SMZ02003NI)
Main participants
Státní zdravotní ústav
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Molekulárně genetická typizace kmenů Streptococcus pyogenes: emm typizace
Annotation in Czech
V NRL pro streptokoky a enterokoky, jediné laboratoři v České republice provádějící typizaci kmenů S.pyogenes, bude zavedena genetická metoda - emm typizace. Nahradí pracnou a z hlediska typovatelnosti kmenů málo efektivní standardní metodu sérologickou.Metoda umožní sledování genotypů nezbytných pro vytvoření typově specifické vakcíny nové generace. Jednoznačně prokáže identitu či rozdílnost izolátů při řešení epidemiologických otázek. Emm typizace umožní porovnávat výsledky v mezinárodním měřítku.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30302 - Epidemiology
30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
An internationally comparable emm genotyping method developed within this project provides a clearly superior typeability rate for S.pyogenes strains compared to conventional serotyping.Emm data were submitted to the Europ.database -type specif. vaccine.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MZ0-NI-U/01:1
Data delivery date
Jun 23, 2006
Finance
Total approved costs
3,207 thou. CZK
Public financial support
1,384 thou. CZK
Other public sources
1,822 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
3 207 CZK thou.
Public support
1 384 CZK thou.
43%
Provider
Ministry of Health
CEP
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
Solution period
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005