Modern pattern recognition methods for image data analysis in neuropsychiatric research
Project goals
The presented project suggests creation of authorized software utilizable in the clinical practice for computer-aided diagnostics of neuropsychiatric disorders from MRI brain images. The project proposal comes from the experience with existing software packages which are nowadays utilized in the neuroimaging community and also from our original methodology for brain morphology assessment in first episode schizophrenia. The software, which is the main subject of the proposed project, will connect complexmethods for 3-D MRI brain image processing and analysis with an advanced assessing apparatus based on pattern recognition and machine learning methods. A new tool for automated analysis of image data will be developed for the application field of computational neuroanatomy. Besides common comparisons among groups of patients and normal subjects, it will make it possible to set a new type of classification assessment , even in the case of an individual analyzed subject, in contrast to VBM and DBM.
Keywords
image processingcomputational neuroanatomydeformable registrationpattern recognitionclassificationMRIbrain imagesmultimodal methods
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Departmental Programme of Research and Development - MH II from 2008 to 2011
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví II 2 (SMZ0200901)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NS10347-3/2009
Alternative language
Project name in Czech
Moderní metody rozpoznávání pro analýzu obrazových dat v neuropsychiatrickém výzkumu
Annotation in Czech
Předkládaný projekt navrhuje vytvořit autorizovaný software využitelný v klinické praxi při počítačové diagnostice neuropsychiatrických poruch z MRI obrazů mozku. Návrh projektu vychází ze zkušeností s existujícími softwarovými balíky, které jsou v současné době využívány v neurozobrazovací komunitě a dále z vlastní metodiky pro hodnocení morfologie mozku při první epizodě schizofrenie. Plánovaný software, který je hlavním předmětem předkládaného projektu, v sobě bude spojovat komplexní metody zpracování a analýzy 3-D MRI obrazů mozku s následným hodnotícím aparátem založeným na metodách rozpoznávání a strojového učení. Vznikne tak nový prostředek pro automatickou analýzu obrazových dat v oblasti výpočetní neuroanatomie, který na rozdíl od existujícíchmetod VBM (voxel-based morphometry) a DBM (deformation-based morphometry) umožní vedle konvenčního srovnávání souborů pacientů a zdravých kontrol také nový typ klasifikačního hodnocení, a to i v případě individuálního analyzovaného subjektu.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EI - Biotechnology and bionics
CEP - secondary branch
FH - Neurology, neuro-surgery, nuero-sciences
CEP - another secondary branch
—
20801 - Environmental biotechnology
20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management
20803 - Environmental biotechnology related ethics
20901 - Industrial biotechnology
20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation
20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials
30103 - Neurosciences (including psychophysiology)
30210 - Clinical neurology
30401 - Health-related biotechnology
30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)
30405 - Medical biotechnology related ethics
40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology
40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming
40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Authorized software usable in the clinical practice for computer-aided diagnosis of neuropsychiatric disorders from imaging data. , including algorithms for deformation -based brain morphometry, image data reduction and classification.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Aug 8, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MZ0-NS-U/09:3
Data delivery date
Oct 31, 2013
Finance
Total approved costs
856 thou. CZK
Public financial support
856 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
856 CZK thou.
Public support
856 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Health
CEP
EI - Biotechnology and bionics
Solution period
01. 01. 2009 - 31. 12. 2011