Determination of SNP and DNA methylation profiles in patients with myelodysplatic syndrome by microarrays.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Departmental Programme of Research and Development - MH II from 2008 to 2011
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví II 1 (SMZ0200801)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NS9634-4/2008
Alternative language
Project name in Czech
Stanovení SNP a DNA methylačního profilu u pacientů s myelodysplastickým syndromem pomocí mikročipové technologie.
Annotation in Czech
Anotace I. Předmětem předkládaného projektu je vytvoření SNP a DNA methylačního profilu pacientů s myelodysplastickým syndromem. Anotace II. K vytvoření profilů bude použita mikročipová technologie firmy Illumina, konkrétně "Cancer SNP Panel" pro detekci1421 jednonukleotidových polymorfismů nacházejících se v 408 genech a "Methylation Cancer Panel" pro detekci 1505 CpG lokusů vybraných z 807 genů.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
MDS is a hematologic disease at which we monitored methylation profiles and single nucleotide polymorphisms within the association study. We found an association with DNA repair genes and hypermethylation of promoters of several transcription factors.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Aug 8, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-MZ0-NS-U/09:3
Data delivery date
Oct 31, 2013
Finance
Total approved costs
5,986 thou. CZK
Public financial support
5,986 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK