Molecular Characterization of B-cell Receptors and Their Relationship to Evolution of Gemonic Aberrations in Chronic Lymphocytic Leukemia
Project goals
Variable course of chronic lymphocytic leukemia (CLL) is influenced by many factors. The signalization via B-cell receptor (BCR) belongs among them; its intensity depends on the molecular properties of BCR. This results in variable proliferative potential of malignant cells which influence heterogeneous accumulation of genetic changes. Within the project we will focus on stereotyped BCR incidence and their detailed molecular characterization in defined CLL set. We will use novel genomic technologies and cytogenetic methods to study genetic changes in CLL samples and we will analyze them in parallel with clinical data with respect to specific BCR prevalence. For analysis of trouble-making cases with multiple IG rearrangements we will introduce single-cell multiplex PCR for complete assessment of heavy and light IG chain rearrangements in combination with the mutational analysis of other genes. In biclonal CLL we will design clone-specific qPCR for monitoring of coexistence of malignant clones in time.
Keywords
Chronic lymphocytic leukemiaB cell receptorimmunoglobulin genestereotyped subsetgenomic aberrations
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Ministry of Health?s Departmental Research and Development Programme III
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 3 (SMZ0201201)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NT13493-4/2012
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární charakterizace B buněčných receptorů a jejich vztah k evoluci genetických změn u chronické lymfocytární leukémie
Annotation in Czech
Na variabilním průběhu chronické lymfocytární leukémie (CLL) se podílí řada faktorů. K významným patří signalizace B buněčnými receptory (BCR), jejíž intenzita závisí na molekulárních vlastnostech BCR. Výsledkem je variabilní proliferační potenciál maligních buněk ovlivňující heterogenní akumulaci genetických změn. V rámci projektu se zaměříme na stanovení výskytu stereotypních BCR a jejich podrobnou molekulární charakterizaci v definovaném souboru CLL. Využijeme nové genomické technologie a cytogenetické metody ke studiu genetických změn v CLL vzorcích a společně s klinickými údaji je budeme analyzovat s ohledem na zastoupení specifických BCR. Pro analýzu problematických případů s vícečetnými přestavbami IG zavedeme „single cell“ multiplexní PCR analýzu pro kompletní stanovení přestaveb těžkých i lehkých řetězců IG v kombinaci s vyšetřením mutací v dalších genech. U biklonálních CLL navrhneme klonálně specifické real-time PCR pro sledování koexistence maligních klonů v čase.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
FD - Oncology and haematology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Specific stereotyped BCR subsets are associated with increased frequency of gene mutations with negative prognostic impact in CLL. Clonal composition of CLL cells in selected patient groups was described using developed single cell techniques.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 20, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MZ0-NT-U/02:1
Data delivery date
Dec 19, 2016
Finance
Total approved costs
8,737 thou. CZK
Public financial support
8,737 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
8 737 CZK thou.
Public support
8 737 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Health
CEP
FD - Oncology and haematology
Solution period
01. 04. 2012 - 31. 12. 2015