Genomics for the modern diagnostics and treatment of childhood leukaemias
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202000001
Main participants
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU20-07-00322
Alternative language
Project name in Czech
Genomika pro moderní diagnostiku a léčbu dětských akutních leukemií
Annotation in Czech
Genomické postupy v posledních letech významně prohloubily naše znalosti o genomickém podkladu dětských akutních leukemií. Abychom dále detailněji specifikovali genetickou a genomickou klasifikaci, použijeme metody sekvenování nové generace (zejména celotranskriptomové a celogenomové sekvenování) ke klasifikaci dosud geneticky nedefinovaných podskupin akutní lymfoblastické leukemie (ALL), ke studiu biologických a prognostických vlastností subtypů, které jsme v minulosti spoludefinovali, a k rozšíření malých, geneticky definovaných zajímavých podskupin ALL. Dále otestujeme možnosti celotranskriptomového sekvenování v diagnostice dětských akutních myeloidních leukemií (AML) bez známé genetické aberace. Porovnáme tento přístup s panelovým sekvenováním, které je v současnosti považováno za nový standard oboru. Chceme vytvořit nový diagnostický algoritmus pro nové dětské AML.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30209 - Paediatrics
OECD FORD - secondary branch
30205 - Hematology
OECD FORD - another secondary branch
30101 - Human genetics
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology<br>FG - Paediatrics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project has a significant professional contribution. The genetic and genomic characterization of childhood acute leukemias has been deepened, and the use of whole-transcriptome sequencing, DNA panel sequencing, and whole-exome and whole-genome sequencing techniques in this field has been studied. The investigator's data are adequate. A new comprehensive diagnostic algorithm for childhood acute myeloid leukemia has been put into practice. The project has resulted in a total of nine publications in IF journals, with seven grant dedications. Four publications are original work by the research team, including a paper in the prestigious journal Leukemia. The results of the project have also been presented at several international conferences with a favourable response. No deficiencies in compliance with the Terms of Reference or in the use of funds were found.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-U
Data delivery date
Jul 3, 2024
Finance
Total approved costs
17,048 thou. CZK
Public financial support
17,048 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK