Spectrum of NGS detected somatic mutations and their association with prognosis and outcome of adolescent and young adult patients with Ph-positive leukemias

Provider

Ministry of Health

Programme

—

Call for proposals

SMZ0202100001

Main participants

Ústav hematologie a krevní transfúze

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

NU21-07-00225

Project name in Czech

Spektrum somatických mutací detekovaných NGS a jejich souvislost s prognózou a léčebnými výsledky dospívajících a mladých dospělých pacientů s Ph pozitivními leukémiemi

Annotation in Czech

Dospívající a mladí dospělí pacienti s Ph+ leukemiemi představují unikátní skupinu pacientů s hematologickými malignitami. Tato onemocnění si vyžadují pečlivé monitorování a dobrou adherenci pacientů k léčbě. Do dnešní doby, přes několik málo klinických studií, specifické aspekty a biologie Ph+ leukémií této věkové skupiny pacientů nebyly detailněji studovány. V současnosti se většina pacientů s diagnózou chronické myeloidní leukémie v chronické fázi (CML-CP) dožívá normální délky života. Před zavedením inhibitorů tyrozinových kináz (TKI) do lékařské praxe byl vyšší věk pacientů negativní prognostický faktor. Nyní v éře TKI se zdá, že dospívající děti a mladí dospělí (dle anglického Adolescents and Young Adults (AYA), ve věku 15-39 let v době diagnózy dle definice National Comprehensive Cancer Network Guidelines) trpící CML-CP mají horší prognózu a odpověď na léčbu TKI. V posledních letech jsou somatické mutace u hematologických malignit dosti studované, nicméně velmi málo je známo o spektru somatických mutací (mimo mutace v onkogenu BCR-ABL1) u AYA pacientů s Ph+ leukemiemi včetně Ph pozitivní akutní lymfoblatické leukémie (Ph+ALL) a jejich souvislosti s rezistencí k léčbě TKI a s relapsy. Předpokládáme, že komplexní skríning na bázi sekvenování nové generace plánované v navrhovaném projektu umožní zjistit, jestli je klonální hematopoéza horším prognostickým faktorem pro AYA pacienty s Ph+ leukemiemi. Domníváme se, že u AYA pacientů s CML a Ph+ALL může být identifikováno podobné spektrum mutací, ale jejich klonální vývoj se může lišit v důsledku odlišných léčebných protokolů. Řešení tohoto projektu pomůže identifikovat vysoce rizikové AYA pacienty s CML, kteří by mohli profitovat z intenzivnějšího léčebného protokolu podobného protokolu u Ph+ALL.

R&D category

AP - Applied research

OECD FORD - main branch

30204 - Oncology

OECD FORD - secondary branch

30205 - Hematology

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

FD - Oncology and haematology

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

1. The main aim of the project was to analyse the significance of clonal hematopoiesis and somatic mutations in a group of adolescent and young adult (AYA) CML patients, with the hypothesis that more somatic mutations lead to a worse prognosis for these patients. The achieved and published results showed that the AYA group of CML patients did not have a significantly higher mutation frequency at the time of diagnosis, but the significance emerged during TKI treatment. The presence of total mutation count is associated with a worse prognosis in AYAs, but in contrast to the elderly, a worse prognosis is not significantly associated with ASXL1 mutation. 2. The investigator's data are adequate. 3. The project's importance lies in its contribution to knowledge in the AYA CML group and elderly patients, as it allows international collaboration. 4. Project outcomes: 1 original Article- publication in Q1/D1 journal, 2 publications in Letter category, Software - CIA accredited. 5. They are not

Realization period - beginning

May 1, 2021

Realization period - end

Dec 31, 2024

Project status

U - Finished project

Latest support payment

Apr 12, 2024

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP25-MZ0-NU-U

Data delivery date

Jul 1, 2025

Total approved costs

16,307 thou. CZK

Public financial support

16,307 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK