Electrochemical biosensor for analysis of DNA point mutations in colorectal cancer
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202100001
Main participants
Masarykův onkologický ústav
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU21-08-00078
Alternative language
Project name in Czech
Elektrochemický biosenzor pro analýzu bodových mutací v DNA u kolorektálního karcinomu
Annotation in Czech
Kolorektální karcinom patří celosvětově mezi nejčastější nádorová onemocnění, přičemž jeho incidence neustále narůstá. Jednou z hlavních příčin vzniku jsou bodové mutace v DNA u genů KRAS, BRAF, EGFR nebo TP53, proto jejich analýza patří mezi slibné prognostické i prediktivní nástroje v léčbě tohoto onemocnění. Současné metody analýzy těchto mutací jsou často komplikované nebo vyžadují drahé přístrojové vybavení a chemikálie. Elektrochemie by mohla být zajímavou alternativou pro svoji jednoduchost, nízkou cenu, rychlost a možnost miniaturizace a paralelní detekce v čipovém formátu pomocí biosenzorů. Navrhovaný projekt je zaměřen na vývoj nové technologie založené na elektrochemické detekci umožňující analýzu panelu bodových mutací DNA u kolorektálního karcinomu. Cílem je vyvinout biosenzor splňující kritéria jako je dostatečná sensitivita (dosažená např. výběrem vhodných amplifikačních technik, zejména izotermálních), selektivita (výběrem vhodných strukturních analogů DNA které efektivněji rozlišují bodové mutace) nebo reprodukovatelnost. Optimalizovaný biosenzor bude aplikován jednak na DNA pocházející z nádorové tkáně pacientů, a rovněž na cirkulující nádorovou DNA, která se běžně nachází v krvi těchto pacientů a představuje tak slibný molekulární biomarker v minimálně invazivní diagnostice ve formě tzv. tekutých biopsií.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FS - Medical facilities, apparatus and equipment
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project NU21-08-00078 achieves an excellent rating. It was carried out with a high level of expertise and made a significant contribution to the field of molecular diagnostics of colorectal cancer. The results of the project - in particular the developed electrochemical point mutation detection technologies using LAMP and RCA - are innovative, experimentally validated on clinical samples and have a clear potential for application in decentralised diagnostics. The data reported by the investigator are complete and correspond to the actual scope and quality of the outputs achieved. The project has overlap with other disciplines, is relevant to personalised medicine and included student education. Outputs include 5 publications in impacted journals and 2 national patents. The use of funds was flawless and in accordance with the tender documentation. The project met all objectives and represents an excellent example of translational research with real clinical impact.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NU-U
Data delivery date
Jul 1, 2025
Finance
Total approved costs
7,649 thou. CZK
Public financial support
7,649 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK