The impact of cytidine metabolic pathways on cytarabine therapy of hematological malignancies and new diagnostic tools for their analysis
Project goals
Cytidine deaminase (CDA) and deoxycytidine monophosphate deaminase (DCTD), deoxycytidine kinase (dCK), 5'-nucleotidase and human equilibrative nucleoside transporter (hENT1) participate in the regulation of cellular nucleotide and nucleoside pools and also in the metabolism of therapeutically significant nucleoside and nucleotide analogs including cytarabine that is commonly used for the treatment of diverse hematological malignancies. As the impact of these metabolic pathways on the results of treatment with cytarabine is not well described, the studies focused on the detailed description of their roles are necessary. Results of the project presented will contribute to the understanding of differences in the response of particular patients to cytarabine and other drugs based on cytidine analogs. Results of the presented project will also allow identification of new biomarkers and provide new diagnostic tools enabling to take the individuality of patient into account. The project presented is focused on i) the analysis of the variability of genes encoding CDA, DCTD, dCK, 5'-nucleotidase, hENT1 with respect to the course and the effectiveness of cytarabine-based treatment; ii)the analysis of the effect of the levels of cytidine deaminase activity in the cancer cells and blood plasma with respect to the course and the effectiveness of the treatment by cytarabine , and iii) the development of a new technology for the fast non-isotopic detection and quantification of DCTD activity in the cells and CDA activity in the cells and in solutions including the blood plasma.
Keywords
biomarkerybiomarkerscytidin deaminázadeoxycytidin monofosfát deaminázacytidine deaminasedeoxycytidine monophosphate deaminasePDX modelyPDX modelsanalogy nukleosidů a nukleotidůanalogs of nucleosides and nucleotides
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202200001
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU22-08-00148
Alternative language
Project name in Czech
Vliv metabolických drah cytidinu na terapii hematologických zhoubných onemocnění pomocí cytarabinu a nové diagnostické nástroje pro jejich analýzu
Annotation in Czech
Cytidinová deamináza (CDA) a deoxycytidin monofosfátová deamináza (DCTD), deoxycytidin kináza (dCK), 5'-nukleotidáza a lidský nukleosidový přenášeč (hENT1) se podílejí na regulaci buněčných koncentrací nukleosidů a nukleotidů a rovněž na metabolismu terapeuticky významných analogů nukleosidů a nukleotidů včetně cytarabinu běžně používaného v léčbě různých hematologických onemocnění. Jelikož vliv těchto metabolických drah na výsledek léčby cytarabinem není dobře popsán, jsou nutné studie zaměřené na detailní popis jejich úlohy. Výsledky předkládaného projektu umožní pochopení rozdílů v odpovědi jednotlivých pacientů na cytarabin a další léky založené na analozích cytidinu. Výsledky předkládaného projektu rovněž umožní identifikovat nové biomarkery a poskytnou nové diagnostické nástroje umožňující vzít do úvahy individualitu pacientů. Předkládaný projekt je zaměřen na i) analýzu variability genů kódujících CDA, DCTD, dCK, 5'-nukleotidázu a hENT1 s ohledem na průběh a efektivitu léčby založené na cytarabinu ; ii) analýzu vlivu úrovně cytidin deaminázové aktivity v nádorových buňkách a krevní plasmě s ohledem na průběh a efektivitu léčby cytarabinem a iii) vývoj nové technologie pro rychlou, neizotopickou detekci a kvantifikaci DCTD aktivity v buňkách a aktivity CDA v buňkách a v roztocích včetně krevní plasmy.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10601 - Cell biology
CE - Biochemistry
EA - Morphology and cytology
EB - Genetics and molecular biology
FS - Medical facilities, apparatus and equipment
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Apr 12, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NU-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
10,318 thou. CZK
Public financial support
10,318 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
10 318 CZK thou.
Public support
10 318 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Health
OECD FORD
Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
Solution period
01. 05. 2022 - 31. 12. 2025