Analysis of patterns of abnormal leukocyte signaling in childhood diseases using mass cytometry and machine learning.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202300001
Main participants
Fakultní nemocnice v Motole
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU23-07-00170
Alternative language
Project name in Czech
Analýza vzorců abnormální signalizace leukocytů u onemocnění dětského věku pomocí hmotnostní cytometrie a strojového učení.
Annotation in Czech
Projekt má za cíl odhalit abnormality v nitrobuněčné signalizaci u pacientů s vrozenými poruchami krvetvorby, které se manifestují širokou škálu příznaků v dětském věku. Navrhujeme studovat odpovědi leukocytů na baterii stimulů přes povrchové receptory u pacientů s prokázanými poruchami signálních drah a využít tyto znalosti pro klasifikaci poruch s neznámou genetickou etiologií. Zapojení signáních drah bude na úrovni jednotlivých buněk sledováno detekce fosfo-epitopů kináz pomocí unikátní metody hmotnostní cytometrie (CyTOF). Výsledná >40 parametrová data budou analyzována metodami umělé inteligence a topologické analýzy s cílem najít komplexní vzorce odpovídající poruchám v signalizaci. Tyto vzorce budou dále využity pro zacílené pokročilé molekulárně genetické studie odhalující molekulární podstatu onemocnění a též pro predikci odpovědi na cílenou léčbu. Vytvoříme zjednodušený cytometrický monitoring efektu podané cílené léčby. Studie je koncipována jako observační, s využitím biobankovaného materiálu pacientů ale i prospektivních vzorků.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30209 - Paediatrics
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FG - Paediatrics
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-R
Data delivery date
Feb 21, 2024
Finance
Total approved costs
15,597 thou. CZK
Public financial support
15,597 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK