Genetic, transcriptomic and metabolic profiles of patients after liver transplantation with respect to the development of NAFLD/NASH.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Main participants
Institut klinické a experimentální medicíny
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-26906A
Alternative language
Project name in Czech
Genetický, transkriptomický a metabolický profil pacientů po transplantaci jater ve vztahu k rozvoji NAFLD/NASH.
Annotation in Czech
Nealkoholická jaterní steatóza (NAFLD) se pojí se zvýšeným rizikem kardiovaskulárních chorob a vyšší celkovou mortalitou. U pacientů po transplantaci jater je prevalence NAFLD/NASH (steatohepatitida) ve srovnání s běžnou populací významně vyšší. Identifikace časných známek NAFLD/NASH může být relevantní pro další predikci rozvoje onemocnění nejenom u transplantovaných pacientů, ale i v běžné populaci. Zaměříme se na tyto oblasti: 1. profilace rizikových alel vybraných genů asociovaných s vyšší pravděpodobností rozvoje steatózy v genomu příjemce; 2. přítomnost inzulínové rezistence a změn v energetickém metabolismu ve svalu a v játrech příjemce; 3. identifikace změn v expresi (aktivace/suprese) specifických metabolických drah ve štěpu metodou microarray (na úrovni transkriptomu). Dále se zaměříme na validaci neinvazivních metod, které mohou indikovat časné fáze NAFLD. Využijeme možnosti vzájemně korelovat údaje získané magnetickou rezonanční spektroskopií a elastografií s histologickým hodnocením a transkriptomickými daty.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
This project fulfilled the original objectives. Authors and co-authors present original data. The discussion of the results is critical and corresponding to the conclusions. The data obtained brought new information with regard to the development of the non-alcoholic fatty liver disease after liver transplantation. Pre-transplantation metabolic state of the recipient (liver disease, inflammatory state, metabolic syndrome, insulin resistance etc.) is the main factor influencing future development of the graft pathology. The presence of PNPLA3 c.444G and TM6SF2 c.499A alleles in the graft was associated with a significantly increased risk of graft steatosis, their effect being additive. Genotype of the recipient with respect to polymorphisms in genes associated with NAFLD. The top upregulated transcripts were PLIN1 a ME1 while P4HA1, IGF1 and fetuin B were down-regulated in steatotic samples. They predicted the potential upstream regulators that may modulate the gene expression in steato
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jul 1, 2020
Finance
Total approved costs
16,348 thou. CZK
Public financial support
16,348 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK