Detailed analysis of human rotavirus infections in the Czech Republic including atypical and emergent strains: development of new diagnostic methods
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)
Main participants
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-29937A
Alternative language
Project name in Czech
Komplexní analýza humánních rotavirových infekcí v České republice včetně atypických a emergentních kmenů směřující k vývoji nových detekčních metod
Annotation in Czech
Projekt se zaměřuje na rotaviry skupin A, B a C (RVA, RVB a RVC), které patří celosvětově k významným původcům gastroenteritid dětí i dospělých. V České republice je běžně prováděna diagnostika RVA antigenu ve vzorcích stolice, nicméně prevalence RVB a RVC u dětských i dospělých pacientů není známá. RVC byl prokázán jako původce gastroenteritid v některých evropských zemích a RVB je běžně diagnostikován v Asii jako původce průjmů dospělých. Zvýšená migrace obyvatelstva, prokázaný zoonotický potenciál rotavirů a stárnutí populace odůvodňují potřebu výzkumu v této oblasti. Ohroženy jsou zejména sociálně slabé skupiny obyvatelstva se sníženými hygienickými standardy včetně imigrantů z rozvojových zemí. Cílem projektu bude provést epidemiologickou studii u různých věkových skupin obyvatelstva a na základě sekvenční a fylogenetické analýzy s použitím celogenomového sekvenování stanovit zastoupení cirkulujících genotypů. Na základě získaných údajů bude vyvinuta diagnostická metoda založená na PCR, která umožní detekci všech skupin humánních rotavirů, jejichž výskyt lze v populaci očekáv...
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Rotaviral gastroenteritis is an important issue even in the vaccination era affecting both pediatric and elderly population. The project has been conducted successfully and fullfiled the original aims. It has brought several original findings about incidence and characteristics of circulating strains in the Czech Republic. Also, the investigators have suggested a diagnostic methods based on RT-qPCR for clinical detection of RVA and RVC in patient stool samples. The study has followed one health approach - samples from patients, controls, pigs and wasted water were tested. The results were published in 2 articles in journals with impact factors (IF 3,81 a 0,39) and other 4 peer-reviewed papers.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jul 1, 2020
Finance
Total approved costs
8,144 thou. CZK
Public financial support
8,144 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK