Diagnostic and prognostic impact of miRNA expression profiles related to morphological heterogeneity in triple-negative breast cancer
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-31997A
Alternative language
Project name in Czech
Diagnostické a prognostické dopady korelace miRNA expresního profilu s morfologickou heterogenitou u "triple-negative" karcinomů prsu
Annotation in Czech
Přestože se spektrum biomarkerů užívaných v onkologii neustále rozšiřuje, zůstává stanovení morfologie nádorů rozhodujícím kritériem diagnostiky. U karcinomů prsu bylo nedávno zjištěno, že stupeň diferenciace je provázen změnami exprese miRNA. Není však nic známo o tom, zda popsané změny souvisí se změnou morfologie a zda mají individuální nebo obecný charakter. Cílem navrhovaného projektu je použít zatím unikátní přístup a srovnat expresní profil miRNA z různých částí téhož nádoru s rozdílnou morfologickou charakteristikou i nádorů se stejnou morfologií od různých pacientek a zároveň zjistit, zda je možné tyto specifické miRNA detekovat v krvi. Pro řešení navrhujeme použít mikrodisekční metody izolace buněk z parafínových bloků TNBC a mikročipovou analýzu miRNA. Tkáňové a sérové hladiny vybraných miRNA budou sledovány pomocí qPCR v rozšířeném validačním souboru a jejich funkce bude studována pomocí experimentů na buněčných liniích. Projekt by mohl přispět k odhalení nových principů řídících morfogenezi v nádorech a rovněž k identifikaci nových diagnostických a prognostických znaků.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FD - Oncology and haematology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was focused on the analysis of changes in miR expression in TNBC. The aim was to evaluate the association of miR dysregulations with the morphological changes of the tumor, to elucidate the function of selected miRs and also to evaluate their diagnostic and prognostic potential. Initially, the miR expression profile of the tumor was analyzed in all 25 planned TNBC patients. Using laser microdissection, samples were obtained from sites with different morphologies, which were then analyzed. Based on expression and bioinformatics analysis, candidate miRs characterizing the individual morphological entities were selected. According to the plan, blood sera and tissue samples were collected and analyzed for a validation study, as well as in vitro testing of the function of selected miRs. Tumor parts with a certain morphology in TNBC were found to be characterized by a specific miR expression profile. Many of the selected miRs play an important role in the epithelial-mesenchymal
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jun 25, 2021
Finance
Total approved costs
11,990 thou. CZK
Public financial support
11,902 thou. CZK
Other public sources
88 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK