Novel test for classical and variant Niemann-Pick type C disease. Evaluation of pathogenicity of frequent NPC1 alleles implicated in late-onset NPC.

Project name in Czech
Nový test pro klasickou a variantní Niemann-Pickovu chorobu typu C. Zjištění patogenity častých alel spojovaných s pozdními formami NPC.
Annotation in Czech
Niemann-Pickova choroba typu C (NPC) se může projevit poprvé v jakémkoli věku a zejména v dospělosti může být diagnostikována pozdě nebo chybně. Nový kvantitativní diagnostický test pro NPC, který podstatně usnadní diagnostiku nemoci, je založen na zátěži buněk cholesterol-dextranovými nanočásticemi (Chol/Dex) pro zvýraznění rozdílů v koncentracích metabolitů mezi pacienty s NPC a kontrolami. Deuterovaný cholesterol v Chol/Dex dovolí kvantifikaci endocytovaného cholesterolu tandemovou hmotnostní spektrometrií. Optimalizovaný test bude proveden ve více než 25 kulturách kožních fibroblastů pacientů s různými formami NPC a bude vypočítán poměr cholesterol/cholesteryl ester. Technikou CRISPR-Cas9 připravíme buněčné linie homozygotní pro časté varianty v genu NPC1 spojované s dospělou formou nemoci a pomocí testu určíme jejich patogenitu. Test bude upraven pro užití v bílých krvinkách a kultivovaných lymfocytech a bude zhodnoceno jeho možné diagnostické využití.

R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FH - Neurology, neuro-surgery, nuero-sciences
CEP - secondary branch
FP - Other medical fields
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches (according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) 10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3) 10605 - Developmental biology 10608 - Biochemistry and molecular biology 10609 - Biochemical research methods 30101 - Human genetics 30103 - Neurosciences (including psychophysiology) 30106 - Anatomy and morphology (plant science to be 1.6) 30107 - Medicinal chemistry 30108 - Toxicology 30109 - Pathology 30210 - Clinical neurology 30221 - Critical care medicine and Emergency medicine 30223 - Anaesthesiology 30224 - Radiology, nuclear medicine and medical imaging 30225 - Allergy 30226 - Rheumatology 30227 - Geriatrics and gerontology 30229 - Integrative and complementary medicine (alternative practice systems) 30230 - Other clinical medicine subjects 30307 - Nursing 30308 - Nutrition, Dietetics 30309 - Tropical medicine 30310 - Parasitology 30311 - Medical ethics 30312 - Substance abuse 30501 - Forensic science 30502 - Other medical science

Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The authors developed a new functional test for Niemann-Pick disease type C diagnostics. The main measured parameter was the ratio of mass- labelled cholesterol to cholesterol esters in fibroblasts cultures treated with cholesterol/dextran particles. The test is quantitative, distinguished between patients and controls, allows easy interpretation and does not require the use of radioisotopes but it is not exercisable in blood cells. This diagnostic method could be used routine praxis and was successfully patented.

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MZ0-NV-U/03:1
Data delivery date
Jul 1, 2020

Similar projects(10)