Identification of diagnostic markers in colorectal cancer by profiling of trascriptome, DNA methylome and microbiome in adenoma-carcinoma transition
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 4 (SMZ0201800001)
Main participants
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV18-03-00199
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace diagnostických ukazatelů pro kolorektální karcinom na základě transkriptomických, metylomových a mikrobiomových profilací v procesu přechodu od adenoma ke karcinomu.
Annotation in Czech
Nádory tlustého střeva a konečníku (CRC) patří mezi tři nejčastější maligní onemocnění na světě. Protože většina kolorektálních karcinomů se vyvíjí z adenomatózních polypů, časná identifikace těchto adenomů v konečném důsledku sniží úmrtnost na CRC. Navzdory časnému kolonoskopickému odstranění polypů přetrvává u některých pacientů zvýšené riziko vzniku CRC. Na druhou stranu ne všichni jedinci s adenomy tlustého střeva mají vyšší riziko rozvoje CRC ve srovnání s obecnou populací. V předkládaném projektu se v prospektivní studii zaměříme na současnou profilaci transkriptomu a DNA metylomu u adenomů tlustého střeva. Průvodní analýza mikrobiomu sledovaných pacientů s adenomy přispěje k dalšímu ustavení specifických charakteristik, poukazujících na individuální riziko vývoje CRC. Výše uvedené ukazatele budou validovány u nezávislé skupiny osob s adenomy, u kterých je k dispozici dlouhodobé sledování. Kandidátní marker budou podrobeny funkčnímu testování in vitro. Naše studie mohou přispět k nalezení citlivých ukazatelů, predikujících riziko vzniku CRC.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30218 - General and internal medicine
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
30204 - Oncology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>FD - Oncology and haematology<br>FE - Other fields of internal medicine
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
All planned experiments have been carried out in the project, and others have been added beyond the project. Publication activity was excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jun 22, 2023
Finance
Total approved costs
10,809 thou. CZK
Public financial support
10,662 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
147 thou. CZK