Comprehensive prognostic and predictive panel for chronic lymphocytic leukemia: a next-generation sequencing tool suitable for clinical practice and study of genetic architecture behind the disease evolution
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV19-03-00091
Alternative language
Project name in Czech
Komplexní prognostický a prediktivní panel pro pacienty s chronickou lymfocytární leukémií: nástroj sekvenování nové generace vhodný pro klinickou praxi i studium genetického pozadí průběhu choroby
Annotation in Czech
Chronická lymfocytární leukémie (CLL) je častou a stále nevyléčitelnou leukémií dospělých, která je charakterizována mimořádnou genetickou i klinickou heterogenitou. V navrhovaném projektu se zaměříme na studium genetického pozadí klonální evoluce u neléčených pacientů s CLL, přičemž budeme sledovat vývoj změn ve vzorcích sbíraných opakovaně v průběhu onemocnění. Naším hlavním cílem je časné odhalení rizika progrese choroby a potřeby léčby. Plánujeme zhodnotit jak prognostický tak prediktivní význam genomických změn detekovaných před podáním terapie. Pro tento účel zavedeme vysoce komplexní test sekvenování nové generace (NGS), který současně analyzuje základní i nové biomarkery CLL. Využijeme výhod tzv. „capture-based” NGS, které umožňuje paralelně analyzovat IGHV mutační status, rekurentní chromozomové a genové defekty i klonalitu lehkých imunoglobulinových řetězců. Předpokládáme, že náš NGS panel navržený konkrétně pro CLL bude používán v klinické praxi jako jednoduchý komplexní test umožňující lepší prognostifikaci pacientů.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The original goal of the project - to create a comprehensive prognostic and predictive panel for patients with chronic lymphocytic leukemia: it was extended to the most common types of non-Hodgkin's lymphomas (DLBCL, FL, MCL, BL) and ALL. A universal NGS panel called LYNX (LYmphoid NeXt generation sequencing) was created, which allows analysis of mutations in 67 selected genes, chromosome aberrations at the level of the whole genome and analysis of the most frequent translocations and rearrangements of antigen receptors (IG and TR). The NGS panel LYNX was registered as a utility model at the Industrial Property Office and was published with the exclusive dedication of the project. In connection with this project, 8 Jimp - original articles were created in a peer-reviewed professional periodical from the WoS database with the flag Article and 1 article in a peer-reviewed professional periodical from the WoS database with the Review or Letter flag. The LYNX panel is currently used by cli
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 19, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jun 22, 2023
Finance
Total approved costs
14,426 thou. CZK
Public financial support
14,426 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK