Functional Assays for Rapid Microbiological Diagnostics of Selected Health-Care Associated Infections
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Main participants
Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV19-05-00541
Alternative language
Project name in Czech
Funkční metody pro rychlou mikrobiologickou diagnostiku vybraných infekcí spojených se zdravotní péčí
Annotation in Czech
Infekce spojené se zdravotní péčí (HCAI) významně ovlivňují současnou medicínu a limitují rozvoj některých invazivních zákroků. Léčba HCAI je obvykle komplikovaná rezistencí původců na dostupná antibiotika. Ke snížení nevhodné iniciální terapie, která často vede k selhání léčby, je nutné se zaměřit na vývoj nových rychlých diagnostických testů. Především se jedná o metody funkční diagnostiky, které reagují na současný stav horizontálního toku genetické informace. V rámci řešení projektu budou vyvinuty a validovány testy pro detekci některých bakteriálních toxinů (např. toxin B produkovaný Clostridium difficile, YopT produkovaný Yersinia enterocolitica) pomocí metody afinitní MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Zároveň budou optimalizovány metody pro detekci karbapenemáz dříve vyvinuté v laboratoři spoluřešitele. Pro detekci kolistinové rezistence bude vyvinuta metoda umožňující detekci modifikace lipidu A. Všechny zmíněné metodiky reagují na urgentní potřebu rutinní mikrobiologické diagnostiky a umožní detekovat i potenciálně neznámé patogeny s ohledem na horizontální přenos genetické informace.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was solved in accordance with the planned goals, which were successfully fulfilled. Several methods based on the principle of MALDI-TOF mass spectrometry have been developed, which have the potential to improve the diagnosis of infectious diseases. First of all, it is the detection of carbapenemases of the OXA-48 type based on the detection of beta-lactone formation. Furthermore, disposable targets for MALDI-TOF MS analyses were developed using 3D printing from conductive material. A test for the functional detection of toxins A and B produced by Clostridioides difficile was developed. The new method allows the detection of modified forms of procalcitonin. Regarding lipopolysaccharide lipid A, a method of extraction of the whole molecule has been developed, which will also allow typing of microbes using MALDI-TOF mass spectrometry. The results have a significant application potential.The results were published in 3 journals in Q1 and Q2, aggregate IF 18.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 19, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jun 22, 2023
Finance
Total approved costs
9,063 thou. CZK
Public financial support
9,063 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK