Proteotype classification of renal cell carcinoma for prognosis and therapy response

Project name in Czech
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
Annotation in Czech
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.

R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology

Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In the final report, the researchers describe the project in detail in all 4 individual objectives. The course of the project was fully in line with the approved application. The investigators have adequately described the use of the grant in the annual reports. Funding for the last extension year was covered with previously underspent funds. The management of financial and resources during the implementation was rational and in line with the project. The results achieved are mostly in line with the scientific intent as described in the project application. The most significant results are the findings that PLOD-2 protein appears to be a marker of renal cancer risk and that glycoprotein NMB (GPNMB) plays an important role in sunitinib therapy. These new findings have been the topic of a series of articles submitted for publication in high quality journals.

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jul 3, 2024

Similar projects(10)