Alternative splicing of KIR genes in allogeneic hematopoietic transplants
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202400001
Main participants
Fakultní nemocnice Plzeň
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NW25-03-00338
Alternative language
Project name in Czech
Alternativní sestřih KIR genů u alogenních hematopoetických transplantací
Annotation in Czech
Alogenní transplantace hematopoetických buněk je kurativní léčba pro mnohé hematologické malignity. I přes to, že se rozšířili kritéria na výběr optimálního dárce a přes velký progres v post-transplantační terapii, je tato terapie zatížena významnou morbiditou a mortalitou. Proto se stále hledají další parametry, které mohou nejen dále vylepšit selekci dárců, ale zároveň lépe předpovídat reakci imunitního systému a preemtivně reagovat. NK buňky představují složku nespecifické imunity s kritickou rolí zejména v prvních třech měsících po transplantaci. Jejich reaktivita je regulována aktivačními a inhibičními signály přes široké spektrum povrchových receptorů. Nejvýznamnější skupinou receptorů jsou KIR (Killer immunoglobulin-like receptor), které mohou být jak aktivační, tak inhibiční. Jedná se o vysoce polymorfní geny, jejichž polymorfizmy mohou ovlivňovat funkci NK buněk. Jejich variabilita však nekončí jen na úrovni DNA, ale je evidována také u RNA molekul. V rámci RNA hraje svou roli tzv. alternativní sestřih (AS). AS je proces, kdy dochází k modifikaci RNA molekul, což má za následek vznik několika isoforem této molekuly s následným ovlivněním proteinové struktury. Již byli detekovány rozlišné isoformy KIR molekul, nikdy však v rámci kontextu hematopoetických transplantací a u většího souboru jedinců. Pro určení vlivu těchto molekul je nejprve nutné zjistit, jaké je jejich zastoupení v rámci většího souboru dárců a případně určit, jaká je jejich kinetika. Z naši předchozí studie vyplývá, že KIR exprese je dynamický proces a tudíž je otázkou, zda je tato dynamika pozorována i u jednotlivých isoforem. Tato zjištění nám pomohou lépe určit potencionální vliv isoforem KIR genů na NK asociovanou imunitní odpověď po alogenní transplantaci hematopoetických buněk a případně zjistit potencionální využití z hlediska predikce chování NK buněk.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30205 - Hematology
OECD FORD - secondary branch
30102 - Immunology
OECD FORD - another secondary branch
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
AF - Documentation, librarianship, work with information<br>BC - Theory and management systems<br>BD - Information theory<br>EC - Immunology<br>FD - Oncology and haematology<br>IN - Informatics
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2028
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MZ0-NW-R
Data delivery date
Apr 2, 2025
Finance
Total approved costs
12,491 thou. CZK
Public financial support
12,491 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK