Molecular tools for outcome prediction of kidney transplantation from marginal donors

Provider

Ministry of Health

Programme

—

Call for proposals

SMZ0202600001

Main participants

Institut klinické a experimentální medicíny

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

NW26-06-00299

Project name in Czech

Molekulární nástroje pro predikci výsledků transplantace ledvin od marginálních dárců

Annotation in Czech

Zvyšující se podíl odebraných ledvin od zemřelých dárců, které jsou následně kontraindikovány k transplantaci, představuje významný lékařský problém. Identifikace ledvin od starších dárců, které jsou vhodné k transplantaci protože dosáhnou akceptovatelných dlouhodobých výsledků, může zvýšit počet dárců, což řeší hlavní potřebu současné transplantační medicíny. Celogenomové transkriptomické vyšetření biopsií dárců spolu s metodami strojového učení umožňuje zpřesnit stratifikaci dárců nad rámec tradičních klinických metrik. Naše studie spolu s dalšími výzkumy ukázala, že některé ledviny transplantované od starších dárců nebo dárců s vysokým indexem rizika (KDRI) mohou mít stále přijatelnou funkci v prvním roce. V rámci předkládaného grantu, bude aplikovatelnost již vytvořeného modelu ověřena pro identifikaci ledvin s lepší prognózou pouze ve skupině dárců s rozšířenými kritérii (ECD) a také u dárců po smrtí oběhu (DCD), kde jsou orgány vystaveny teplé ischémii. Pomocí microarray bude vyšetřena genová exprese u ECD (n=130) a DCD (n=60). Pro validaci modelu budou použita data z existujících externích kohort (n=308). Následně budeme charakterizovat vývoj transkriptomu v čase od biopsie nulté hodiny do 3 měsíců po transplantaci ledviny (n=340), abychom zlepšili schopnost modelu předpovídat rychlou progresi fibrózy. Model bude zpřesněn jednak zvětšením velikosti souboru a dále využitím nově dostupných technik strojového učení (prototypové kontrastní učení). Vytvořený model umožní přesnější odhad funkce štěpu (eGFR) po transplantaci, což je zásadní v rozhodnutí o imunosupresivní léčbě, která bývá často modifikována v případech, kdy není dosaženo adekvátní funkce štěpu.

R&D category

AP - Applied research

OECD FORD - main branch

30213 - Transplantation

OECD FORD - secondary branch

—

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

FJ - Surgery including transplantology

Realization period - beginning

Jan 1, 2026

Realization period - end

Dec 31, 2029

Project status

Z - Beginning multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP26-MZ0-NW-R

Data delivery date

Mar 23, 2026

Total approved costs

12,995 thou. CZK

Public financial support

12,995 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK