Automated Framework for Quantitative Spinal Cord MRI Analysis

Provider

Ministry of Health

Programme

—

Call for proposals

SMZ0202600001

Main participants

Fakultní nemocnice Olomouc

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

NW26J-04-00101

Project name in Czech

Automatizovaný nástroj pro kvantitativní MRI analýzu míchy

Annotation in Czech

Magne­tická rezonance (MRI) míchy hraje důležitou roli v monitorování a praktickém managmentu široké škály onemocnění míchy tím, že poskytuje kvantitativní biomarkery odrážející klinický stav a umožňující predikci progrese onemocnění. MRI biomarkery, jako je plocha míchy či frakční anizotropie, jsou klíčové pro hodnocení asymptomatické komprese míchy (ADCC) a degenerativní cervikální myelopatie (DCM). Vzhledem k tomu, že ADCC postihuje až 40 % jedinců a přibližně čtvrtina z nich během 44 měsíců progreduje do symptomatické DCM, je včasné a přesné hodnocení zásadní pro efektivní klinické rozhodování a plánování chirurgického zákroku. V současnosti zůstává správa a zpracování MRI dat a výpočet MRI biomarkerů do značné míry závislé na manuální práci, což je časově náročnáý proces vnášející variabilitu mezi experty, která omezuje reprodukovatelnost a klinické využití v longitudinálních a multi-centrických studiích. Tento projekt má za cíl vývoj uceleného nástroje pro automatickou analýzu MRI dat míchy. Nejprve budou vyvinuty nové MRI biomarkery umožňující kvantitativní hodnocení makro- a mikrostruktury míchy a páteřního kanálu. Dále bude implementován ucelený softwarový nástroj integrující zpracování MRI snímků založené na umělé inteligenci (AI), včetně segmentace míchy a páteřního kanálu, detekce komprese, automatizovaného výpočtu biomarkerů a generování komplexních PDF zpráv s vizuálními výstupy. Nakonec bude tento nástroj validován na longitudinálních kohortách pacientů s ADCC a DCM ve dvou univerzitních nemocnicích. Tento ucelený nástroj poskytne klinikům uživatelsky přívětivou metodu pro získání kvantitativních MRI biomarkerů, které ve spojení s etablovanými klinickými a elektrofyziologickými testy zlepší monitorování a klinické rozhodování u ADCC jedinců a DCM pacientů.

R&D category

AP - Applied research

OECD FORD - main branch

30210 - Clinical neurology

OECD FORD - secondary branch

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

OECD FORD - another secondary branch

30103 - Neurosciences (including psychophysiology)

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

AF - Documentation, librarianship, work with information<br>BC - Theory and management systems<br>BD - Information theory<br>FH - Neurology, neuro-surgery, nuero-sciences<br>IN - Informatics

Realization period - beginning

Jan 1, 2026

Realization period - end

Dec 31, 2029

Project status

Z - Beginning multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP26-MZ0-NW-R

Data delivery date

Mar 23, 2026

Total approved costs

8,473 thou. CZK

Public financial support

8,473 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK