Advancing Yeast Pathogens Surveillance: Long-Read Genomics for Resistance and Epidemiology
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202600001
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NW26J-05-00043
Alternative language
Project name in Czech
Pokročilé sledování kvasinkových patogenů: Sekvenace pomocí dluhých čtení pro studium rezistence a epidemiologii
Annotation in Czech
Invazivní kvasinkové infekce, zejména ty způsobené druhy Candida, jsou významnou příčinou morbidity a mortality u hospitalizovaných a imunokompromitovaných pacientů. Tento projekt si klade za cíl pokročit v monitorování kvasinkových patogenů za využití celogenomové sekvenace pomocí dlouhých čtení ke studiu jejich rezistence a epidemiologie. Rostoucí prevalence non-albicans druhů a multirezistentních kmenů, jako jsou Candida auris, Candida parapsilosis a Nakaseomyces glabratus, představuje vážnou výzvu pro klinická pracoviště. Použitím celogenomové sekvenace a vysoce výkonných molekulárních přístupů tento výzkum umožní zkoumat genetické determinanty antifungální rezistence a sledovat šíření rezistentních klonů. Projekt vytvoří základ pro molekulární epidemiologii pro invazivních kandidóz, což umožní lepší sledování, antifungální stewardship a v konečném důsledku i zlepšení výsledků léčby. Integrace aktuálních bioinformatických nástrojů a interaktivní databáze usnadní sledování rezistence v reálném čase a podporu klinických rozhodnutí, čímž se řeší naléhavá potřeba standardizovaných monitorovacích protokolů a zlepšených opatření pro kontrolu infekcí.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30302 - Epidemiology
OECD FORD - secondary branch
30303 - Infectious Diseases
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2026
Realization period - end
Dec 31, 2029
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP26-MZ0-NW-R
Data delivery date
Mar 23, 2026
Finance
Total approved costs
8,498 thou. CZK
Public financial support
8,498 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK