The characterization of potato's genotypes using DNA fingerprinting
Project goals
The contemporary list of permitted potato varieties containes 102 genotypes including 32 of Czech origin. These varieties are described by using of morfological and economical characters. These descriprions seem to be unsufficient for precise and fast identification of unknown samples and it would be convenient to complete them by means of molecular genetic techniques. These techniques are used on the limited number of varieties in our institute and were not yet worked out in our country for utilizationin potato industry. The identifications by means of genetic markers are for this purpose very important. The introduction of fingerprinting on the base of DNA analysis would help to improve checking of variety genuity and purity. It could positively influence protection law of varieties in market with potato seed etc. The latest knowledge in the field of RAPD, mapping and sequencing plant projects and experience in telomere and subtelomere analysis will be utilised. The aim of this project is to d
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
Scheme I
Call for proposals
Program I (SMZE2001_1_1)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, s.r.o.Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace genotypů bramboru metodou DNA fingerprintingu
Annotation in Czech
Současný sortiment odrůd brambor povolených v ČR zahrnuje 102 odrůd z toho je 32 odrůd českých. Tyto odrůdy jsou popsány s využitím morfologických a hospodářských znaků. Pro přesnou a rychlou identifikaci neznámého vzorku je však tato charakteristika jako nedostatečná a je nutné ji doplnit o techniky molekulární identifikace odrůd. V podmínkách naší republiky se v současné době tyto metodiky u brambor propracovávají na našem pracovišti na omezeném spektru 30 odrůd, převážně českého původu, což je dobrýmzákladem pro jejich rutinní využívání. Zavedení "fingerprintingu" na základě analýzy DNA by pomohlo ke zkvalitnění kontroly odrůdové pravosti a čistoty, což by se mohlo pozitivně odrazit v zajištění právní ochrany odrůd, v obchodování se sadbou a podobně. Ve vlastním řešení tohoto projektu budou využívány nejnovější poznatky z oblasti RAPD, mapovacích a sekvenačních projektů rostlinných genomů a zkušenosti s analýzou telomer a subtelomer. Posláním tohoto projektu je zavedení využívání molekulá
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
40105 - Horticulture, viticulture
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Průběh řešení a výsledky odpovídají smlouvě.Cíl byl naplněn, požadované výstupy byly zpracovány.Jsou předloženy nové výsledky týkající se variability genomu bramboru.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2001
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MZE-QC-U/04:1
Data delivery date
Jun 29, 2006
Finance
Total approved costs
4,700 thou. CZK
Public financial support
4,700 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
4 700 CZK thou.
Public support
4 700 CZK thou.
0%
Provider
Ministry of Agriculture
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2001 - 01. 01. 2005