Early selection of peach genotypes on resistance against Sharka (PPV) using molecular genetic methods.
Project goals
The Aim of project is to find and verify methods that allow early selection of peach genotypes resistant against the Sharka virus (PPV) on the basis of studies its heredity on DNA level. Degrees of resistance (sensitive, medium susceptible and resistant)will be verified on the selected set of peach genotypes including 3 different degrees of resistance against PPV in woody indicator GF-305, ELISA and PCR analysis. The DNA will be isolated from selected set of genotypes for the next analyses. Further suitable primers that are able to distinguish between mixes of susceptible and resistant genotypes by BSA analyses (Bulk Segregant Analysis) will be used for next analyses. Methods RAPD and SSR in the analyses of DNA will be used. On basis of suitable primers will be made DNA analysis of all selected genotypes. All record will be processed into database and statistically evaluated from reproducibility and variability point of view. Furthermore relation between degrees of resistance against PPV and variabil
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
Scheme II
Call for proposals
Program II (SMZE2001_2_1)
Main participants
Mendelova univerzita v Brně
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Raný výběr genotypů broskvoní na rezistenci vůči šarce švestek (PPV) molekulárně genetickými metodami.
Annotation in Czech
Cílem tohoto projektu je najít a ověřit metody umožňující raný výběr genotypů broskvoní s rezistencí vůči Šarce švestek (PPV) na základě studia její dědičnosti na úrovni DNA. U vybraného souboru genotypů broskvoní zahrnující 3 různé stupně rezistence (citlivé, středně citlivé a rezistentní) bude ověřen stupeň rezistence vůči PPV. Z uvedeného souboru bude izolována DNA pro další analýzy. Dále pak budou hledány analýzou BSA (Bulk Segregant Analysis) vhodné primery, které dokážou rozlišit citlivé a rezistentní genotypy. K analýze DNA budou využity metody RAPD a SSR. Na základě takto vybraných primerů bude provedena analýza DNA u všech vybraných genotypů. Veškeré výsledky budou zpracovány do databáze a statisticky vyhodnoceny z hlediska opakovatelnosti a variability. Na základě získaných výsledků bude sledována míra shody zjištěných markerů a stupně rezistence. Získané výsledky budou následně ověřeny na náhodně vybraném vzorku a na dalších genotypech z genofondu Zahradnické fakulty. Na řešitelském pracovi
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
40105 - Horticulture, viticulture
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
N - Nesplněno zadání
Project results evaluation
Projekt nesplnil hlavní stanovený cíl.Mezi sledovanými amplifikačními produkty nebyl nalezen žádný markér rezistence vůči PPV, a to i přes dodržení metodiky a plánovaného rozsahu prací (viz. zdůvodnění příjemce projektu).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2001
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MZE-QD-U/04:1
Data delivery date
Jun 29, 2006
Finance
Total approved costs
1,300 thou. CZK
Public financial support
1,300 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 300 CZK thou.
Public support
1 300 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Agriculture
CEP
GE - Plant cultivation
Solution period
01. 01. 2001 - 01. 01. 2005