Development of new DNA marker types and evaluation of their potetial for barley genome investigation, marker assisted selection and genotype identification

Provider

Ministry of Agriculture

Programme

Scheme II

Call for proposals

Program II (SMZE2001_2_1)

Main participants

SELGEN, a. s.<br>Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

—

Project name in Czech

Vývoj nových typů DNA markerů a zhodnocení jejich potenciálu pro studium genomu ječmene a možnosti jejich aplikace ve šlechtění a identifikaci genotypů.

Annotation in Czech

Sladovnický ječmen patří v ČR i v mezinárodním měřítku mezi významné plodiny s velice dobrou šlechtitelskou tradicí. České odrůdy vykazují velmi dobrou sladovnickou kvalitu a některé ovlivnily i evropské šlechtění. I když pomocí tradičních postupů byla vyšlechtěna řada výkonných odrůd s vysokou jakostí, je zřejmé, že jednou z možností, jak zvýšit efektivitu šlechtění je zavedení molekulárních markérů pro volbu vhodných rodičovských komponent i selekci potomstva. Byla připravena řada markérů na základěRFLP, RAPD, SSR nebo AFLP, avšak řada z nich je využitelná pouze na omezeném počtu odrůd. Proto je třeba hledat další možné soubory materiálů, na kterých se makéry odvozují a nové typy markerů. Jednou z možností je retrospektivní analýza s využitím vazebného dis-ekvilibria (DLM), která bude prověřována v navrhovaném projektu. Stejná sada AFLP a SSR markerů bude použita pro charakterizaci rekombinantních inbredních linií a pro sadu genotypů, které se vyskytují v rodokmenu rodičovských komponent. Současn

R&D category

NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)

CEP classification - main branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - secondary branch

GE - Plant cultivation

CEP - another secondary branch

EI - Biotechnology and bionics

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

Malting barley belong to the most important cereals in Czech republic and generally in the world. Czech cultivars are of very good malting quality and they had an impact even on European breeding. Using traditional approaches several superior cultivars

Realization period - beginning

Jan 1, 2001

Realization period - end

Jan 1, 2004

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2005/MZE/MZE5QD/U/N/4:1

Data delivery date

Jun 30, 2005

Total approved costs

4,900 thou. CZK

Public financial support

4,900 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK