DNA barcoding of Czech aquatic insects: building a database of reference sequences
Project goals
Reliable reference database is a crucial requirement for widespread use of modern progressive methods based on DNA analyses. These can be utilised for organism identification and consequent evaluation of ecosystem's species richness, estimates of biodiversity loss, presence of rare and endangered species, or expansion of invasive species. This project aims to develop a reference database of DNA barcode sequences for five major aquatic insect groups inhabiting the Czech Republic. The outcome of this project comprises a database including multiple specimens of each species, each expertly determined and paired with a DNA sequence. Such a reference database could be used to advance innovative monitoring methods like environmental DNA (eDNA) or metabarcoding.
Keywords
aquatic insectsbarcodingbiodiversity monitoringfreshwater ecosystems
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
—
Call for proposals
STA02025SQ010
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
SQ01020207 - Smlouva o poskytnutí podpory
Alternative language
Project name in Czech
DNA barcoding vodního hmyzu ČR: vytvoření databáze referenčních sekvencí
Annotation in Czech
Spolehlivá referenční databáze představuje základní předpoklad pro široké používání moderních progresivních metod založených na analýzách DNA. Ty mohou být využity pro identifikaci organismů a následné vyhodnocování druhové bohatosti ekosystémů, odhalování úbytku biodiverzity, přítomnost vzácných či ohrožených druhů, případně šíření invazních druhů. Cílem projektu je vytvoření referenční databáze tzv. barkódovacích sekvencí DNA pro pět zásadních skupin vodního hmyzu vyskytujících se na území ČR. Výstupem projektu je databáze expertně určených jedinců jednotlivých druhů s přiřazenými sekvenčními daty. Referenční databázi bude možné využít při rozvíjení nových inovativních metod monitoringu jako je např. environmentální DNA či metabarcoding.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2025
Realization period - end
Feb 29, 2028
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP25-TA0-SQ-R
Data delivery date
Mar 14, 2025
Finance
Total approved costs
13,869 thou. CZK
Public financial support
10,402 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
3,467 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
13 869 CZK thou.
Public support
10 402 CZK thou.
75%
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
OECD FORD
Entomology
Solution period
01. 03. 2025 - 29. 02. 2028