DNAquaIMG: Innovating transnational aquatic biodiversity monitoring using high-throughput DNA tools and automated image recognition
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
SS73020001 - Smlouva o poskytnutí podpory
Alternative language
Project name in Czech
DNAquaIMG: Inovace nadnárodního monitoringu sladkovodní biodiverzity pomocí vysoce výkonných nástrojů analýzy DNA a automatizovaného rozpoznávání obrazu
Annotation in Czech
Ve spolupráci s institucemi zajišťujícími monitoring vodních ekosystémů budou diskutovány možnosti aplikace metod založených na analýze DNA a analýze obrazu. Shromážděné informace o parametrech biologických vzorků (makrozoobentos a rozsivky) vyhodnotíme z hlediska možné aplikace inovativních metod na existující materiál nebo potřeby nových sběrů. S využitím tohoto materiálu budou v projektu testovány a laděny postupy obou metod. Aktivity týkající se molekulárních metod budou směřovány k rozvoji rutinních postupů, automatizace, úložišť dat, doplňování knihoven DNA sekvencí pro morfologicky určené taxony, kontrole kvality a vypracování doporučení osvědčených postupů. Možnosti širšího využití metod analýzy obrazu v praktickém monitoringu sladkovodní biodiverzity vyplývají ze současných pokroků těchto technologií. Projekt se zaměří na použití analýzy obrazu pro rozlišování taxonů a odhad biomasy (velikostního spektra). Inovativní indikátory budou testovány v případových studiích.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10617 - Marine biology, freshwater biology, limnology
OECD FORD - secondary branch
10619 - Biodiversity conservation
OECD FORD - another secondary branch
10503 - Water resources
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
DA - Hydrology and limnology<br>EH - Ecology - communities
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 28, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP25-TA0-SS-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
4,646 thou. CZK
Public financial support
3,944 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
703 thou. CZK