Efficiency (economic and time) optimization of the bone marrow donor verification process
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
Programme of applied research and experimental development ALFA
Call for proposals
ALFA 4 (STA02014TA04)
Main participants
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
2014TA04010727
Alternative language
Project name in Czech
Optimalizace (ekonomické a časové) efektivnosti verifikačních procesů vyhledávání dárce kostní dřeně
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na vývoj pokročilých metod a nástrojů podpory při verifikaci dárce vybraného pro transplantaci kostní dřeně. Cílem nově vyvinutých metod a nástrojů je zvýšení ekonomické a časové efektivnosti při vyhledávání vhodného dárce a to využitím přímých záznamů DNA sekvencí HLA (Human Leukocyte Antigen) i non-HLA charakteristik. Integrované metody budou též zajišťovat adaptibilitu systému registru dárců kostní dřeně vůči vysoce progresivní oblasti hematoonkologie. Hlavní náplní projektu je vývoj nové třídy DNA-based nástrojů, včetně metod a algoritmů, sloužících pro podporu rozhodování odborníků během verifikace potenciálně vhodného dárce. Vývoj řeší problematiku s hlediska organizace a interpretace velkého počtu dat (big data) a s hlediska optimalizace procesů nad velkým počtem dat. Etapy projektu se postupně zaměřují na koncepty datové organizace, definice optimalizace, návrh algoritmů a testování algoritmů v laboratorním prostředí a ve stávajícím informačním systému. V celkovém průběhu projektu se též řeší nástroje pro automatizované propojení DNA dat a poznatků v mezinárodní společnosti.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
IN - Informatics
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project succeeded according to the assignment. The project objective was achieved during the project; the results under the Aid Agreement were partially achieved (output X has not been applied yet). The tool to optimize the effectiveness of the verification processes of bone marrow donor search will be gradually put into practice. The review committee agreed that the solution of this project contributed to the program goal with new results suitable for implementation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 28, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP18-TA0-TA-U/04:1
Data delivery date
Aug 15, 2019
Finance
Total approved costs
9,000 thou. CZK
Public financial support
5,850 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
3,150 thou. CZK