The Open Data Exchange Ecosystem in Proteomics: Evolving its Utility
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
Programme of applied research and experimental development EPSILON
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
TH86010001 - Smlouva o poskytnutí podpory
Alternative language
Project name in Czech
Ekosystém pro sdílení volně dostupných proteomických dat: Rozšíření jeho funkcí.
Annotation in Czech
Hlavním cílem ODEEP-EU je zefektivnit opětovné použití veřejných dat z oblasti proteomiky. Důležité je, že toto opětovné použití veřejně dostupných dat, které musí být podpořeno volně dostupnými zdrojovými kódy a softwarem, je spojeno s třemi klíčovými aspekty: (i) vytvoření a udržení referenčních datasetů včetně jejich anotace a návodů na opětovné použití; (ii) snížení složitosti postupů pro opětovné použití pomocí anotace metadat, dostupnosti vysoce kvalitních dat pro danou problematiku a existence volně dostupných softwarových řešení pro opětovnou analýzu; a (iii) integrace již existujících frameworků (z projektu ELIXIR) pro sdílení volně dostupných softwarů a zálohování do systému Software Heritage. V rámci projektů propojíme vědeckou komunitou (zejména v oblastech struktury bílkovin, biochemie, molekulární a terénní biologie) v akademické sféře a průmyslu. Výsledkem bude existence stabilního a důvěryhodného prostředí pro uchovávaní proteomických dat včetně opětovnému použití.
Scientific branches
R&D category
VV - Exeperimental development
OECD FORD - main branch
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10406 - Analytical chemistry
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation<br>CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 28, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP25-TA0-TH-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
4,680 thou. CZK
Public financial support
3,976 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
704 thou. CZK