Use of microsatellite markers for verification of clonal identity and diversity in small-leaved linden (Tilia cordata Mill)
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F19%3AN0000002" target="_blank" >RIV/00020702:_____/19:N0000002 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vulhm.cz/aktivity/vydavatelska-cinnost/lesnicky-pruvodce/" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/aktivity/vydavatelska-cinnost/lesnicky-pruvodce/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Využití mikrosatelitových markerů pro ověřování klonové identity a diverzity u lípy srdčité (Tilia cordata Mill.)
Original language description
Cílem metodiky je představit postupy analýz DNA s využitím mikrosatelitových markerů pro získání genetických charakteristik u porostů lípy srdčité a pro objektivní ověřování deklarované identity klonů např. v semenných sadech nebo v klonových archivech. Metodika popisuje postupy odběru rostlinných vzorků, izolace DNA, podmínky polymerázové řetězové reakce, postupy fragmentační analýzy, hodnocení velikostí produktů amplifikace a statistické výpočty molekulárních dat. K vývoji této metodiky byl použit vybraný semenný sad lípy srdčité. Pro získání genetických parametrů za účelem ověření klonální identity a úrovně genetické rozmanitosti mezi různými genotypy bylo vybráno 8 polymorfních jaderných mikrosatelitových markerů.
Czech name
Využití mikrosatelitových markerů pro ověřování klonové identity a diverzity u lípy srdčité (Tilia cordata Mill.)
Czech description
Cílem metodiky je představit postupy analýz DNA s využitím mikrosatelitových markerů pro získání genetických charakteristik u porostů lípy srdčité a pro objektivní ověřování deklarované identity klonů např. v semenných sadech nebo v klonových archivech. Metodika popisuje postupy odběru rostlinných vzorků, izolace DNA, podmínky polymerázové řetězové reakce, postupy fragmentační analýzy, hodnocení velikostí produktů amplifikace a statistické výpočty molekulárních dat. K vývoji této metodiky byl použit vybraný semenný sad lípy srdčité. Pro získání genetických parametrů za účelem ověření klonální identity a úrovně genetické rozmanitosti mezi různými genotypy bylo vybráno 8 polymorfních jaderných mikrosatelitových markerů.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
40102 - Forestry
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1810258" target="_blank" >QK1810258: Proposal of alternative tree species composition for forest ecosystems with reduced ecological stability due to physiological dryness</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
LP 4/2019
Regulation ID
63885/2019-MZE-16222/M197
Technical parameters
Smlouva o uplatnění metodiky č. CM-4/2019 byla uzavřena 22. 11. 2019 s Ústavem pro hospodářskou úpravu lesů Brandýs nad Labem, IČ: 00020681. Odpovědná osoba za uživatele metodiky: Ing. Jaromír Vašíček, CSc., ředitel, ÚHÚL, Brandýs nad Labem, Nábřežní 1326, 250 01 Brandýs nad Labem, e- mail: Vasicek.Jaromir@uhul.cz, tel. č. 321 021 111
Economical parameters
Pro kalkulaci ekonomického přínosu lípy při použití kvalitního genetického zdroje se vycházelo z údajů o domácím obchodu s pilařskou kulatinou buku a kalkulovaný zvýšený čistý výnos představuje 41 726 Kč.ha-1. Pro uživatele znamená metodika finanční úsporu vynaloženou na vývoj postupů DNA analýz při určování klonové identifikace a zjišťování diverzity porostů lípy srdčité pro využití pro kontrolní mechanismy. Poznatky o diverzitě také podpoří využití genově bohatších porostů, odolnějším vůči změnám klimatu. Lze předpokládat i ekonomický přínos ve zvýšení tržeb z těžby dřeva u vlastníků lesa v podobě budoucích zvýšených výnosů z porostů založených kvalitním reprodukčním materiálem. Poznatky o diverzitě populací také napomáhají plnit cíle Státní politiky živ. prostředí a mezinárodní závazky ČR při ochraně biologické rozmanitosti, zároveň se naplňují cíle Národního programu ochrany a reprodukce genofondu lesních dřevin podporovat kvalitní genetické zdroje a ověřovat jejich identitu metodou DNA markerů.
Certification body designation
Ministerstvo zemědělství, Těšnov 17, Praha 1
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů