Evaluation of genetic diversity and clonal identity of European larch using microsatellite markers
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F20%3AN0000072" target="_blank" >RIV/00020702:_____/20:N0000072 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vulhm.cz/files/uploads/2021/01/612.pdf" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/files/uploads/2021/01/612.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Hodnocení genetické diverzity a klonové identity modřínu opadavého pomocí mikrosatelitových markerů
Original language description
Cílem práce bylo zjistit možnosti využití SSR markerů pro hodnocení klonové identity roubovanců u semenných sadů modřínu opadavého (Larix decidua Mill.) a posoudit vhodnost markerů pro sledování genetické diverzity u populací modřínu opadavého. K identifikaci klonové příslušnosti bylo využito 13 polymorfních mikrosatelitových lokusů uspořádaných do dvou multiplexů. Na základě provedených fragmentačních analýz u souboru 218 jedinců ze dvou semenných sadů byly získány statistické charakteristiky 13 mikrosatelitových markerů. Celkově bylo detekováno 155 rozdílných alel v 13 lokusech. Nejvíce polymorfní se jevil lokus bcLK211, u kterého bylo identifikováno 20 rozdílných alel u sledovaného souboru vzorků, a nejméně polymorfní byl lokus Ld101, u něhož bylo detegováno pouze 5 alel. Na základě provedených analýz byly stanoveny multilokusové genotypové profily (MLG) jednotlivých klonů modřínu opadavého v semenných sadech Bílovice a Pabožek. U semenného sadu Bílovice byla shoda genotypových profilů jedinců u sledovaných klonů při použití 13 SSR markerů potvrzena v 73,81 % případů. V analyzovaném souboru bylo možné 167 roubovanců přiřadit k příslušným ortetům, tedy 98,24 % ramet bylo možné přiřadit k ortetům zastoupeným v semenném sadě. V případě semenného sadu Pabožek bylo v rámci 48 deklarovaných zastoupených klonů zjištěno 40 rozdílných multilokusových profilů. Využití DNA analýz při výběrů stromů do šlechtitelských programů se jeví jako užitečný doplňkový šlechtitelský nástroj, např. pro provedení rodičovských analýz či určení ekotypu modřínu resistentního vůči rakovině modřínu.
Czech name
Hodnocení genetické diverzity a klonové identity modřínu opadavého pomocí mikrosatelitových markerů
Czech description
Cílem práce bylo zjistit možnosti využití SSR markerů pro hodnocení klonové identity roubovanců u semenných sadů modřínu opadavého (Larix decidua Mill.) a posoudit vhodnost markerů pro sledování genetické diverzity u populací modřínu opadavého. K identifikaci klonové příslušnosti bylo využito 13 polymorfních mikrosatelitových lokusů uspořádaných do dvou multiplexů. Na základě provedených fragmentačních analýz u souboru 218 jedinců ze dvou semenných sadů byly získány statistické charakteristiky 13 mikrosatelitových markerů. Celkově bylo detekováno 155 rozdílných alel v 13 lokusech. Nejvíce polymorfní se jevil lokus bcLK211, u kterého bylo identifikováno 20 rozdílných alel u sledovaného souboru vzorků, a nejméně polymorfní byl lokus Ld101, u něhož bylo detegováno pouze 5 alel. Na základě provedených analýz byly stanoveny multilokusové genotypové profily (MLG) jednotlivých klonů modřínu opadavého v semenných sadech Bílovice a Pabožek. U semenného sadu Bílovice byla shoda genotypových profilů jedinců u sledovaných klonů při použití 13 SSR markerů potvrzena v 73,81 % případů. V analyzovaném souboru bylo možné 167 roubovanců přiřadit k příslušným ortetům, tedy 98,24 % ramet bylo možné přiřadit k ortetům zastoupeným v semenném sadě. V případě semenného sadu Pabožek bylo v rámci 48 deklarovaných zastoupených klonů zjištěno 40 rozdílných multilokusových profilů. Využití DNA analýz při výběrů stromů do šlechtitelských programů se jeví jako užitečný doplňkový šlechtitelský nástroj, např. pro provedení rodičovských analýz či určení ekotypu modřínu resistentního vůči rakovině modřínu.
Classification
Type
J<sub>SC</sub> - Article in a specialist periodical, which is included in the SCOPUS database
CEP classification
—
OECD FORD branch
40102 - Forestry
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1810129" target="_blank" >QK1810129: Proposal of methodological procedures for implementation of the control system for declared origin of reproductive material by DNA analysis for selected important forest tree species used for artificial forest renewal in conditions of the Czech Republic</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Zprávy lesnického výzkumu
ISSN
0322-9688
e-ISSN
1805-9872
Volume of the periodical
65
Issue of the periodical within the volume
4
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
9
Pages from-to
288-296
UT code for WoS article
000631645100007
EID of the result in the Scopus database
2-s2.0-85103103284