Possibility of variance of transcription detection after stressors treatment

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F03%3A%23%23%23%23%23196" target="_blank" >RIV/00027006:_____/03:#####196 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00027006:_____/03:196

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů

Original language description

Studovali jsme možnost využití kvantitativní PCR v reálném čase (QRT PCR) pro sledování zrněn v expresi genů po působení stresorů. Jako modelová rostlina byl zvolen ječmen. V rámci modelového experimentu byl sledován vliv chladového stresu. Je známo, ženásledkem chladového stresu se zvyšuje produkce některých proteinů, které jsou označovány jako dehydriny. Nebyly zaznamenán délkový polymorfismus sledovaných amplikonů mezi 3 odrůdami. V rámci studie jsme optimalizovali jednotlivé kroky QRT PCR analýzy.Jako nejvhodnější z testovaných postupů izolace RNA nejlepší výsledky poskytl protokol s využitím sady Quiagen. Použití oligodT zajistilo efektivní průběh reverzní transkripce. Výsledek QRT PCR byl závislý na výchozí koncentraci RNA v reakční směsi. V rozsahu experimentálního uspořádání bylo možné využít jako referenční gen ubiquitin. Za testovaných podmínek chladového stresu jsme nezjistili změny a rozdíly v expresi genů Dhn 6, 7, 9, 11. Změny v expresi genů Dhn 5 a 8 byly zaznamenány. QR

Czech name

Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů

Czech description

Studovali jsme možnost využití kvantitativní PCR v reálném čase (QRT PCR) pro sledování zrněn v expresi genů po působení stresorů. Jako modelová rostlina byl zvolen ječmen. V rámci modelového experimentu byl sledován vliv chladového stresu. Je známo, ženásledkem chladového stresu se zvyšuje produkce některých proteinů, které jsou označovány jako dehydriny. Nebyly zaznamenán délkový polymorfismus sledovaných amplikonů mezi 3 odrůdami. V rámci studie jsme optimalizovali jednotlivé kroky QRT PCR analýzy.Jako nejvhodnější z testovaných postupů izolace RNA nejlepší výsledky poskytl protokol s využitím sady Quiagen. Použití oligodT zajistilo efektivní průběh reverzní transkripce. Výsledek QRT PCR byl závislý na výchozí koncentraci RNA v reakční směsi. V rozsahu experimentálního uspořádání bylo možné využít jako referenční gen ubiquitin. Za testovaných podmínek chladového stresu jsme nezjistili změny a rozdíly v expresi genů Dhn 6, 7, 9, 11. Změny v expresi genů Dhn 5 a 8 byly zaznamenány. QR

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/QC1336" target="_blank" >QC1336: Development and employment of new approaches for monitoring of genetic diversity and large-scale screening of genetic resources</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2003

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Vliv abiotických a biotických stresorů na vlastnosti rostlin

ISBN

80-86555-27-5

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

4

Pages from-to

90-93

Publisher name

Výzkumný ústav rostlinné výroby, ČZU Praha

Place of publication

Výzkumný ústav rostlinné výroby, ČZU Praha

Event location

Výzkumný ústav rostlinné výroby, Praha

Event date

Oct 8, 2003

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—