Evaluation of genetic diversity of Brassica napus germplasm from China and Europe assessed by RAPD markers
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F03%3A2460" target="_blank" >RIV/00027006:_____/03:2460 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Evaluation of genetic diversity of Brassica napus germplasm from China and Europe assessed by RAPD markers
Original language description
The genetic diversity and the relationships among rapeseed germplasm, including a collection of 20 Chinese, 2S Czech, 2 German, 2 French, and 1 English cultivars and breeding materials were evaluated using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers.A total of 79 different polymorphic amplification products were obtained usinglO selected decamer primers. RAPDs revealed a significant level of polymorphism among the accessions. The diversity index (DI) ranged from 1.390 to 3.491, showing a sufficientpotential of selected primers to differentiate among studied genotypes. Three different metrics were used to assess genetic diversity. The best fit between a priori knowledge about germplasm origin and a posteriori grouping was found using Hamman metrics. Cluster analysis based on Hamman pairwise distance comparison divided the studied accessions into three main clusters. The first group included on ly accessions from China, the second group only that from Europe with the exception of Z
Czech name
Hodnocení genetické diverzity genetických zdrojů Brassica napus z Číny a Evropy pomocí RAPD markerů
Czech description
Genetická diverzita a vztah mezi genotypy, zahrnující kolekci 20 čínských, 25 českých, 2 německých, 1 francouzského a 1 anglického genotypu byla stanovena použitím metody RAPD markerů. 79 rozdílných polymorfických amplifikací bylo získáno s využitím 10 vybraných dekamerních primerů.Úroveň polymorfizmu byla významná mezi genotypy. Index diverzity (DI) se pohyboval od 1,390 do 3,491, ukazující, že je možno pomocí vybraných primerů rozlišit studované genotypy. Tři rozdílné metriky byly použity ke stanovenígenetické diverzity. Výsledky ukazují přítomnost nezanedbatelné genetické variability mezi čínskými a evropskými genotypy.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/ME%20325" target="_blank" >ME 325: Measurement for clone variation and type with DNA techniques</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2003
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Plant, Soil and Environment
ISSN
1214-1178
e-ISSN
—
Volume of the periodical
49
Issue of the periodical within the volume
3
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
8
Pages from-to
106-113
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—