Detection, Distribution and Genetic Diversities of Apple Stem Pitting Virus and Apple Stem Grooving Virus in the Czech Republic

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F08%3A00000207" target="_blank" >RIV/00027006:_____/08:00000207 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
Detection, Distribution and Genetic Diversities of Apple Stem Pitting Virus and Apple Stem Grooving Virus in the Czech Republic
Original language description
A reliable and easy to use One-step-(duplex)-RT-PCR tool has been developed for the routine detection of ASPV and ASGV. The nucleotide sequence of 3'ter ASPV genome ('nt' position 8992-9220) of tested Czech isolates has shown highly variable (identity range 80-100%). The sequence analysis of 3'ter ASGV genome ('nt' position 6060-6481), and phylogenetic analysis of tested isolates has shown high homology among the Czech isolates of ASGV. The sequence identity has ranged 'nt' >94-100% and 'aa' >96-100%.
Czech name
Detekce, distribuce a genetická diverzita viru vrásčitosti kmene jabloně a viru žlábkovitosti kmene jabloně v ČR
Czech description
Byla vypracována metoda one-step-(duplex)-RT-PCR pro rutinní detekci ASPV a ASGV. Analýza sekvence 3´konce genomu těchto virů ukázala, že české izoláty ASPV vykazují vysokou variabilitu (80-100% identity sekvence), naopak variabilta u izolátů ASGV je nižší (94-100% identity sekvence).

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD branch
—

Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)