Prevalence and genetic structure of PPV-M in six European countries

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F08%3A00000385" target="_blank" >RIV/00027006:_____/08:00000385 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
Prevalence and genetic structure of PPV-M in six European countries
Original language description
The prevalence of PPV-M, PPV-D and PPV-Rec strains has been evaluated in six European countries - Bulgaria, Czech Republic, France, Serbia, Slovakia and Slovenia. Collected samples were characterised by PCR-based typing targeting two genomic regions located upstream and downstream the recombination breakpoint located in the Nib gene shared by all PPV-Rec isolates. PPV-M isolates were found predominant in 4 of the 6 countries. The genetic diversity of PPV-M populations in Europe were evaluated by sequencing 27 isolates coming from 8 countries. The existence of 2 subclusters within the PPV-M group has been evidenced.
Czech name
Výskyt a genetická struktura izolátů PPV-M v šesti evropských sttech
Czech description
Byl vyhodnocen výskyt kmenů viru šarky švestky PPV-M, PPV-D a PPV-Rec v Bulharsku, České republice, Francii, Srbsku, Slovensku a Slovinsku. Shromážděné vzorky PPV byly charakterizovány na základě PCR dvou oblastí genomu obklopujících místo rekombinace vgenu pro NiB. Izoláty PPV-M převládaly ve čtyřech státech ze šesti. Na základě sekvenování 27 izolátů z osmi států byla analyzována genetická diverzita populací PPV-M v Evropě. Byla zjištěna existence dvou podskupin v rámci kmene PPV-M.

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD branch
—

Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)