DNA chip for detection of Fusariom spp.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F09%3A00000871" target="_blank" >RIV/00027006:_____/09:00000871 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Možnosti stanovení Fusárií pomocí DNA čipu

Original language description

Byl připraven DNA čip pro detekci Fusarium spp., produkujících mykotoxiny trichothecen a moniliformin. Čip byl testován na ověřených sbírkových kmenech F. culmorum, F. poae, F. graminerarum a na vzorcích zrn pšenice napadených Fusariem. DNA čip tvoří oligonukleotidové DNA sondy modifikované na 5´konci primární aminoskupinou, ketré jsou imobilizované na aldehydovaném povrchu skla. Jako templátová DNA pro hybridizaci na DNA čipu byly použity PCR produkty variabilní části Translačního elongačního faktoru 1-alfa (700 bp). Templátová DNA byla značena fluorescenční barvou Cy5 (Alexa5) nebo Cy3 (Alexa3) s pomocí značící PCR nebo dodatečným naznačením PCR produktu s použitím kitu BioPrime Total Genomic Labeling System. Získané výsledky ukazují, že DNA čip je vhodný pro detekci F. graminearum, F. culmorum a F. poae.

Czech name

Možnosti stanovení Fusárií pomocí DNA čipu

Czech description

Byl připraven DNA čip pro detekci Fusarium spp., produkujících mykotoxiny trichothecen a moniliformin. Čip byl testován na ověřených sbírkových kmenech F. culmorum, F. poae, F. graminerarum a na vzorcích zrn pšenice napadených Fusariem. DNA čip tvoří oligonukleotidové DNA sondy modifikované na 5´konci primární aminoskupinou, ketré jsou imobilizované na aldehydovaném povrchu skla. Jako templátová DNA pro hybridizaci na DNA čipu byly použity PCR produkty variabilní části Translačního elongačního faktoru 1-alfa (700 bp). Templátová DNA byla značena fluorescenční barvou Cy5 (Alexa5) nebo Cy3 (Alexa3) s pomocí značící PCR nebo dodatečným naznačením PCR produktu s použitím kitu BioPrime Total Genomic Labeling System. Získané výsledky ukazují, že DNA čip je vhodný pro detekci F. graminearum, F. culmorum a F. poae.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1G46068" target="_blank" >1G46068: Development of DNA arrays and technology application for high throughtput gene identification, genotypisation for characterisation of genetic resources, breeding materials and breeders and consumers rights protection</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2009

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Aktuální otázky stanovení specifické DNA: možnosti efektivního využití při kontrole v zemědělství a potravinářství

ISBN

978-80-87011-59-1

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

3

Pages from-to

—

Publisher name

VÚRV, v.v.i.

Place of publication

Praha

Event location

Praha

Event date

Jan 1, 2009

Type of event by nationality

CST - Celostátní akce

UT code for WoS article

—