Utilization of laboratory methods combination for early diagnostics of European foulbrood (causative agent Melissococcus plutonius)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F17%3A00003862" target="_blank" >RIV/00027006:_____/17:00003862 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN%20978-80-7427-212-7.pdf" target="_blank" >https://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN%20978-80-7427-212-7.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Využití kombinace laboratorních metod pro včasnou diagnostiku hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius)

Original language description

Prokázání hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius) je ve srovnání s morem včelího plodu (původce Paenibacillus larvae) běžnými kultivačními metodami značně obtížnější. V současné době nejsou kultivační postupy této anaerobní grampozitivní bakterie dostatečně selektivní. Tento problém řeší předložená metodika, která zahrnuje kromě kultivačních postupů také metody molekulární biologie: polymerázovou řetězovou reakci (PCR) a vysokokapacitní technologie sekvenování nové generace. Molekulárně genetické metody umožňují spolehlivou detekci patogena v různých vývojových stádiích včel, a to jak v plodu, tak v dospělých včelách. Takovou analýzou dospělých včel je možno predikovat přenos infekce mezi včelstvy, který hrozí zejména ze zalétávání jednotlivých včel do jiných než domovských úlů. Výhodou použití vysokokapacitní sekvenační technologie je také možnost určení vlivu infekce M. plutonius na symbiotické bakterie včely medonosné jako faktoru imunity včelstva. Text zahrnuje podrobně popsané postupy laboratorního zpracování vzorků a bioinformatická zpracování a interpretaci dat. Metodika je využitelná pro potřeby laboratoří zabývající se diagnostikou onemocnění včel, je vhodná i pro potřeby výzkumné či didaktické.

Czech name

Využití kombinace laboratorních metod pro včasnou diagnostiku hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius)

Czech description

Prokázání hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius) je ve srovnání s morem včelího plodu (původce Paenibacillus larvae) běžnými kultivačními metodami značně obtížnější. V současné době nejsou kultivační postupy této anaerobní grampozitivní bakterie dostatečně selektivní. Tento problém řeší předložená metodika, která zahrnuje kromě kultivačních postupů také metody molekulární biologie: polymerázovou řetězovou reakci (PCR) a vysokokapacitní technologie sekvenování nové generace. Molekulárně genetické metody umožňují spolehlivou detekci patogena v různých vývojových stádiích včel, a to jak v plodu, tak v dospělých včelách. Takovou analýzou dospělých včel je možno predikovat přenos infekce mezi včelstvy, který hrozí zejména ze zalétávání jednotlivých včel do jiných než domovských úlů. Výhodou použití vysokokapacitní sekvenační technologie je také možnost určení vlivu infekce M. plutonius na symbiotické bakterie včely medonosné jako faktoru imunity včelstva. Text zahrnuje podrobně popsané postupy laboratorního zpracování vzorků a bioinformatická zpracování a interpretaci dat. Metodika je využitelná pro potřeby laboratoří zabývající se diagnostikou onemocnění včel, je vhodná i pro potřeby výzkumné či didaktické.

Type

N_metC - Methodology certified by the authorised body

CEP classification

—

OECD FORD branch

40301 - Veterinary science

Project

<a href="/en/project/QJ1310085" target="_blank" >QJ1310085: New methods for complex diagnostics of Apis mellifera healh state with applications mainly in prevention of illness and for systems increasing their fitness</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2017

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

ISBN 978-80-7427-212-7

Regulation ID

21222/2017-MZE-16232

Technical parameters

Osvědčení pod č.j. 21222/2017-MZE-16232 o uznání certifikované metodiky bylo vystaveno Ministerstvem zemědělství, Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství dne 30.6.2017. Smlouva o uplatnění certifikované metodiky č. 8/2016 uzavřená dne 31.5.2017 mezi stranami - Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Drnovská 507, 161 06 Praha 6, IČ00027006, DIČ: CZ00027006 (poskytovatel) a Českým svazem včelařů, z.s., Křemencova 8, 110 00 Praha 1, IČ: 00443239, DIČ: CZ00443239, zastoupený předsedkyní Mgr. Jarmilou Machovou a tajemníkem Ing. Petrem Šerákem, (uživatel). Statutární zástupce za VÚRV, v.v.i.: Dr. Ing. Pavel Čermák, ředitel Kontaktní osoba za VÚRV,v.v.i.: RNDr. Tomáš Erban, Ph.D., tel. 233022411, e-mail: erban@vurv.cz ISBN 978-80-7427-212-7 (Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.) ISBN 978-80-87196-23-6 (Výzkumný ústav včelařský,ms.r.o.

Economical parameters

Cenové nároky na vzorek: - extrakce DNA – 100 Kč - PCR s použitím detekčních primerů pro M. plutonius a eubakteriálních primerů – 40 Kč - sekvenování pomocí metody sekvenování nové generace – lze využít sekvenace V4 oblasti genu 16S rRNA za 600 Kč nebo sekvenace V1 až V3 oblasti genu 16S rRNA za 2 200 Kč - celkové náklady na vzorek při použití metody sekvenace nové generace se mohou v současnosti pohybovat dle zvolené metody a započtení práce od cca 1 000 Kč do 2 600 Kč bez DPH. - celkové náklady na přímou PCR analýzu jednoho vzorku se mohou pohybovat po započtení práce v ceně 500 až 1 000 Kč - stanovení M. plutonius pomocí mikrobiologických metod je cca 500 Kč

Certification body designation

Ministerstvo zemědělství, Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství, Těšnov 65/17, 110 00 Praha 1

Date of certification

—

Method of use

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel