Association Analysis (GWAS) of Pea (Pisum sativum L.) and Identification of SNP Markers for Genomic Selection of Economically Important Traits
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F20%3A10149348" target="_blank" >RIV/00027006:_____/20:10149348 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/26296080:_____/20:N0000081 RIV/26784246:_____/20:N0000012
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Asociační analýza (GWAS) hrachu setého (Pisum sativum L.) a identifikace SNP markerů pro genomickou selekci hospodářsky významných znaků
Original language description
Za účelem identifikace DNA markerů spojených s agronomickými znaky (délka rostliny, počet větví, typ olistění, tvar a barva semene, počet a hmotnost semen, HTS, odolnost vůči padlí a PEMV) a kvalitativními znaky semen (obsah N-látek a škrobu) byla provedena asociační analýza (GWAS) u hrachu setého (Pisum sativum L.). Soubor 564 genotypů polního a dřeňového hrachu byl hodnocen v letech 2019 a 2020 na třech lokalitách (Šumperk, Olomouc, Smržice). Pro zjištění SNP variant byla použita metoda DArTseq analýzy sekvenování knihoven DNA s redukovanou komplexitou. Asociační analýzou byla získána sada 376 SNP markerů, jejichž pozice na jednotlivých chromozomech byla určena na základě referenční sekvence hrachu. Pro detekci SNP je uvedena 69 bp dlouhá sekvence přiléhající k asociovaným SNP, kterou lze využít pro všechny známé postupy detekce markerů typu SNP (hybridizačně, enzymaticky, sekvenačně i fyzikálně založené metody detekce SNP). Identifikované markery mohou být využity pro efektivnější šlechtění hrachu.
Czech name
Asociační analýza (GWAS) hrachu setého (Pisum sativum L.) a identifikace SNP markerů pro genomickou selekci hospodářsky významných znaků
Czech description
Za účelem identifikace DNA markerů spojených s agronomickými znaky (délka rostliny, počet větví, typ olistění, tvar a barva semene, počet a hmotnost semen, HTS, odolnost vůči padlí a PEMV) a kvalitativními znaky semen (obsah N-látek a škrobu) byla provedena asociační analýza (GWAS) u hrachu setého (Pisum sativum L.). Soubor 564 genotypů polního a dřeňového hrachu byl hodnocen v letech 2019 a 2020 na třech lokalitách (Šumperk, Olomouc, Smržice). Pro zjištění SNP variant byla použita metoda DArTseq analýzy sekvenování knihoven DNA s redukovanou komplexitou. Asociační analýzou byla získána sada 376 SNP markerů, jejichž pozice na jednotlivých chromozomech byla určena na základě referenční sekvence hrachu. Pro detekci SNP je uvedena 69 bp dlouhá sekvence přiléhající k asociovaným SNP, kterou lze využít pro všechny známé postupy detekce markerů typu SNP (hybridizačně, enzymaticky, sekvenačně i fyzikálně založené metody detekce SNP). Identifikované markery mohou být využity pro efektivnější šlechtění hrachu.
Classification
Type
J<sub>ost</sub> - Miscellaneous article in a specialist periodical
CEP classification
—
OECD FORD branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TN01000062" target="_blank" >TN01000062: Biotechnological centre for plant genotyping</a><br>
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Volume of the periodical
68
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
8
Pages from-to
27-34
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—