Strain of the genus Streptomyces 09VU38 producing siderophores and IAA
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F22%3A10175767" target="_blank" >RIV/00027006:_____/22:10175767 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Kmen rodu Streptomyces 09VU38 produkující siderofory a IAA
Original language description
Kmen Streptomyces sp. 09VU38 byl izolován z tuberosféry brambor pěstovaných v půdě svysokým výskytem obecné strupovitosti brambor. U kmene byla prokázána produkce auxinu a několika sideroforů, které byly určeny UPLC chromatografií s hmotnostní detekcí na základě molekulové hmotnosti, fragmentačního spektra a izotopových píků sideroforu s navázaným atomem železa. Pro podrobnější popis genové výbavy byla extrahována genomická DNA, sekvenován a sestaven genom kmene 09VU38. Celkem bylo identifikováno 31 biosyntetických shluků pro sekundární metabolity, 3 z nich byly na základě homologie identifikovány jako shluky pro biosyntézu sideroforů.
Czech name
Kmen rodu Streptomyces 09VU38 produkující siderofory a IAA
Czech description
Kmen Streptomyces sp. 09VU38 byl izolován z tuberosféry brambor pěstovaných v půdě svysokým výskytem obecné strupovitosti brambor. U kmene byla prokázána produkce auxinu a několika sideroforů, které byly určeny UPLC chromatografií s hmotnostní detekcí na základě molekulové hmotnosti, fragmentačního spektra a izotopových píků sideroforu s navázaným atomem železa. Pro podrobnější popis genové výbavy byla extrahována genomická DNA, sekvenován a sestaven genom kmene 09VU38. Celkem bylo identifikováno 31 biosyntetických shluků pro sekundární metabolity, 3 z nich byly na základě homologie identifikovány jako shluky pro biosyntézu sideroforů.
Classification
Type
G<sub>funk</sub> - Functional sample
CEP classification
—
OECD FORD branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1810370" target="_blank" >QK1810370: Practices establishing nutrient balance in soil for protection of potatoes from diseases and drought</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
FV-21-2022
Numerical identification
FV-21-2022
Technical parameters
Genom kmene Streptomyces sp. 09VU38 obsahuje 31 biosyntetických genových shluků pro syntézu sekundárních metabolitů včetně biologicky aktivních látek, z toho tří skupin sideroforů. V laboratorních podmínkách byla detekována produkce desferrioxaminu D2, E a G1, a kyseliny aspergillové, kromě sideroforů byla zjištěna i produkce auxinu. Kmen je využitelný jako inokulant podporující růst rostlin (PGPR).
Economical parameters
Ekonomické benefity vyplývající z použití kmene jako inokulantu nelze zatím spolehlivě odhadnout. Lepší dostupnost železa v důsledku aktivity sideroforů a další podpůrné aktivity mohou vést ke zvýšení výnosu i omezení výskytu nemocí, např. u obecné strupovitosti brambor, jejíž závažnost se dostatečnou koncentrací dostupných forem železa snižuje, lze při průměrných výnosech a cenách a za pedpokladu zvýšení realizované ceny o 5% očekávat přínos pro pěstitele kolem 8 tis. Kč/ha. Přínos ošetření bude ovšem meziročně kolísat vzhledem k velké variabilitě výskytu nemoci v závislosti na počasí, zejména průběhu srážek, zároveň zatím nelze odhadnout náklady na ošetření.
Application category by cost
—
Owner IČO
00027006
Owner name
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Česká zemědělská univerzita v Praze
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
O - Doposud nevyužívaný výsledek
Licence fee requirement
—
Web page
—