Modification of the system of equations for prediction of genomic breeding value by Single step prediction
Result description
The goal of the methodology is a modification of system of equations of method Animal model to the Single step prediction (SSP) of Genomic breeding value (GEBV). Modification is based on correction of pedigree relationship according realised genomic relationship. Genomic relationship matrix is constructed wit help of SNP (single nucleotide polymorphism) markers, densely covering entire genom. GEBV is used mainly for selection of young animals without own production records.
Keywords
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
Result on the web
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Úprava soustav rovnic pro předpověď genomické plemenné hodnoty (GEPH) jednokrokovou metodou
Original language description
Cílem této metodiky je postup úpravy soustav rovnic animal modelu pro předpověď plemenné hodnoty (PH) na jednokrokovou metodu předpovědi (single step prediction (SSP)) genomické plemenné hodnoty (GEPH). Spočívá v úpravě inverze rodokmenové matice příbuznosti mezi zvířaty pomocí genomické matice příbuznosti. Genomická matice příbuznosti je stanovena na základě SNP (single nucleotide polymorphism) markerů, které hustě pokrývají celý genom. GEPH slouží především k výběru mladých zvířat bez známé vlastní užitkovosti.
Czech name
Úprava soustav rovnic pro předpověď genomické plemenné hodnoty (GEPH) jednokrokovou metodou
Czech description
Cílem této metodiky je postup úpravy soustav rovnic animal modelu pro předpověď plemenné hodnoty (PH) na jednokrokovou metodu předpovědi (single step prediction (SSP)) genomické plemenné hodnoty (GEPH). Spočívá v úpravě inverze rodokmenové matice příbuznosti mezi zvířaty pomocí genomické matice příbuznosti. Genomická matice příbuznosti je stanovena na základě SNP (single nucleotide polymorphism) markerů, které hustě pokrývají celý genom. GEPH slouží především k výběru mladých zvířat bez známé vlastní užitkovosti.
Classification
Type
NmetC - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2011
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
978-80-7403-079-6
Regulation ID
1877/2011-ČPI
Technical parameters
Algoritmus pro sestavení počítačového programu, kterým se upravuje soustava rovnic a výpočet příbuznosti s použitím genetických lokusů. Algoritmus byl zpracován v programovém prostředí SAS, lze upravit při programování v jiných jazycích.
Economical parameters
Metodiku použije ČMSCH pro sestavení vlastního výpočetního postupu, kterým budou hodnoceny celostátní databáze kontroly užitkovosti. Výsledky budou následně využívat všichni chovatelé.
Certification body designation
Česká plemenářská inspekce
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů
Result type
NmetC - Methodology certified by the authorised body
CEP
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
Year of implementation
2011