Primers for distinguishing rainbow trout from commercially available representatives of salmon by real-time PCR using melting curve analysis
Result description
The solution concerns a set of primers for detecting and identifying rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) DNA by melting curve analysis using real-time PCR. The proposed qPCR protocol allows the differentiation of rainbow trout from other members of the family Salmonidae based on the analysis of the melting curves, where rainbow trout gives a completely different value (80,3 °C) than other salmonids (maximum sockeye salmon: 79,7 °C). At the same time, these primers do not amplify the DNA of sockeye salmon and pink salmon, the most commonly used species in salmon products. They thus allow easy and rapid detection of adulteration or species substitution of fish in a product where these salmon species are declared. The potential of such a method is increased by the possibility of indirect detection of one of the most important fish allergens, parvalbumin, in addition to the possible identification/detection of the fish species.
Keywords
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
Result on the web
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Sada primerů pro odlišení pstruha duhového od komerčně dostupných zástupců lososů prostřednictvím real-time PCR s využitím analýzy křivek tání
Original language description
Řešení se týká sady primerů pro detekci a identifikaci DNA pstruha duhového (Oncorhynchus mykiss) prostřednictvím analýzy křivek tání s využitím real-time PCR. Navržený qPCR protokol umožňuje odlišit pstruha duhového od dalších zástupců čeledi Salmonidae na základě analýzy křivek tání, kdy pstruh duhový poskytuje zcela odlišnou hodnotu (80,3 °C) než ostatní lososovité ryby (nejvýše losos sockey: 79,7 °C). Zároveň tyto primery neamplifikují DNA lososa obecného a lososa gorbuši, nejčastěji používané druhy ve výrobcích z lososů. Umožňují tak snadnou a rychlou detekci příměsí nebo druhové substituce ryb ve výrobku, kde jsou tyto druhy lososů deklarovány. Potenciál takové metody je kromě možné identifikace/detekce daného druhu ryby navýšen o možnost nepřímé detekce jednoho z nejvýznamnějších rybích alergenů - parvalbuminu.
Czech name
Sada primerů pro odlišení pstruha duhového od komerčně dostupných zástupců lososů prostřednictvím real-time PCR s využitím analýzy křivek tání
Czech description
—
Classification
Type
Fuzit - Utility model
CEP classification
—
OECD FORD branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Result continuities
Project
LM2018100: Infrastructure for Promoting Metrology in Food and Nutrition in the Czech Republic
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2023
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Patent/design ID
36901
Publisher
CZ001 -
Publisher name
Industrial Property Office
Place of publication
Prague
Publication country
CZ - CZECH REPUBLIC
Date of acceptance
—
Owner name
Výzkumný ústav potravinářský Praha, v. v. i., Praha
Method of use
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel
Usage type
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)
Result type
Fuzit - Utility model
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Year of implementation
2023