Cytogenetic mapping of immunity-related genes in the domestic horse

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F05%3A06000036" target="_blank" >RIV/00027162:_____/05:06000036 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/62157124:16170/05:43871745

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Cytogenetic mapping of immunity-related genes in the domestic horse

Original language description

Chromosomal locations of 19 horse immunity-related loci (CASP1, CD14, EIF5A, FCER1A, IFNG, IL12A, IL12B, IL12RB2, IL1A, IL23A, IL4, IL6, MMP7, MS4A2, MYD88, NOS2A, PTGS2, TFRC, and TLR2) were determined by fluorescence in situ hybridization (FISH). ForIFNG and PTGS2, this study is a confirmation of their previously reported position. In addition, microsatellite (HMBr1) was localized in the same region as IFNG. All genes were assigned to regions of conserved synteny and the data obtained in this studyenhance the comparative human-horse map. Cytogenetic localization of IL6 to ECA4q14-21.1 suggested a new breakage point which changes the order of loci compared to HSA7. The map assignment of these loci serves as anchors for other loci and will aid inthe search for candidate genes associated with traits in the horse.

Czech name

Cytogenetické mapování imunitních genů u koně

Czech description

Metodou fluorescenční in situ hybridizace bylo zmapováno 19 koňských genů (CASP1, CD14, EIF5A, FCER1A, IFNG, IL12A, IL12B, IL12RB2, IL1A, IL23A, IL4, IL6, MMP7, MS4A2, MYD88, NOS2A, PTGS2, TFRC a TLR2). Dále byl lokalizován mikrosatelit (HMBr1), který senachází ve stejné oblasti jako IFNG. Většina zmapovaných lokusů jsou novými markery na cytogenetické mapě koně. Komparativní analýza potvrdila vysoký stupeň konzervace mezi lidskou a koňskou mapou. Na druhé straně byla také potvrzena dřívější pozorováníurůzných druhů, že uvnitř velkých konzervovaných chromosomových bloků se vyskytují malé nekonzervované segmenty. Cytogenetická pozice genu IL6 na koňském chromosomu 4q14-q21.1 svědčí o novém místě zlomu, které mění pořadí genů ve srovnání s lidskýmchromosomem 7.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GP523%2F03%2FP089" target="_blank" >GP523/03/P089: Identification and mapping of genes as a ground of function genomic analysis of innate immunity response in the horses</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Animal Genetics

ISSN

0268-9146

e-ISSN

—

Volume of the periodical

36

Issue of the periodical within the volume

6

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

4

Pages from-to

507-510

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—