Characterization of antibiotic resistance genes in microbiota of carriage water of ornamental fish

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F14%3A%230001258" target="_blank" >RIV/00027162:_____/14:#0001258 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://vetweb.cz/" target="_blank" >http://vetweb.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Výskyt genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry vod akvarijních ryb

Original language description

V této práci jsme charakterizovali frekvenci výskytu vybraných genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry z vody akvarijních ryb bezprostředně po importu do České republiky. Celkem 48 vzorků pocházelo ze tří různých kontinentů. Kvantifikace pomocí real-time PCR ukázala, že gen sul1 byl přítomen u 11 ze 100 bakterií tvořících mikroflóru vody importovaných akvarijních ryb. tet(A) gen byl přítomen u šesti ze 100 bakterií a geny strA, tet(G), sul2 a aadA byly přítomny v 1-2 kopiích na 100 bakterií. Složení bakteriální mikroflóry bylo stanoveno pyrosekvenováním V3/V4 variabilní oblasti genů pro 16S rRNA. Mikroflóra vod akvarijních ryb po importu byla tvořena zejména zástupci kmenů Proteobacteria (48 %), Bacteroidetes (29,5 %), Firmicutes (17,8 %), Actinobacteria (2,1 %) a Fusobacteria (1,6 %). Korelační analýza mezi frekvencí výskytu genů pro rezistence k antibiotikům a složením mikroflóry ukázala, že hlavními rezervoáry genů sul1, sul2, tet(A), tet(B), cat, strA a aadA jso

Czech name

Výskyt genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry vod akvarijních ryb

Czech description

V této práci jsme charakterizovali frekvenci výskytu vybraných genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry z vody akvarijních ryb bezprostředně po importu do České republiky. Celkem 48 vzorků pocházelo ze tří různých kontinentů. Kvantifikace pomocí real-time PCR ukázala, že gen sul1 byl přítomen u 11 ze 100 bakterií tvořících mikroflóru vody importovaných akvarijních ryb. tet(A) gen byl přítomen u šesti ze 100 bakterií a geny strA, tet(G), sul2 a aadA byly přítomny v 1-2 kopiích na 100 bakterií. Složení bakteriální mikroflóry bylo stanoveno pyrosekvenováním V3/V4 variabilní oblasti genů pro 16S rRNA. Mikroflóra vod akvarijních ryb po importu byla tvořena zejména zástupci kmenů Proteobacteria (48 %), Bacteroidetes (29,5 %), Firmicutes (17,8 %), Actinobacteria (2,1 %) a Fusobacteria (1,6 %). Korelační analýza mezi frekvencí výskytu genů pro rezistence k antibiotikům a složením mikroflóry ukázala, že hlavními rezervoáry genů sul1, sul2, tet(A), tet(B), cat, strA a aadA jso

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/ED0006%2F01%2F01" target="_blank" >ED0006/01/01: Center for Advanced Microbiology & Immunology Research in Veterinary Medicine</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2014

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Veterinářství

ISSN

0506-8231

e-ISSN

—

Volume of the periodical

64

Issue of the periodical within the volume

12

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

4

Pages from-to

976-979

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—