Quantification of antibiotic resistance gene abundance in fecal microbiota of pigs from organic and conventional production systems

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F15%3A%230001313" target="_blank" >RIV/00027162:_____/15:#0001313 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Kvantifikace genů antibiotické rezistence v mikrobiálních populacích trusu prasat z konvenčních a ekologických chovů

Original language description

Jedním ze současných trendů v zemědělství je oživení zájmu o ekologickou produkci. Zvýšený zájem o tuto problematiku souvisí zejména se zvýšeným zájmem o welfare hospodářských zvířat v ekologických chovech a naopak negativními dopady spojenými s vyšší spotřebou antibiotik v konvenčních chovech. Na druhou stranu, ekologická produkce je spojena se zvýšenou expozicí zvířat vnějšímu prostředí s potenciálními rezervoáry patogenů. V této práci jsme proto porovnali výskyt genů pro antibiotické rezistence ve střevní mikroflóře prasat z ekologických a konvenčních chovů. Navíc jsme porovnali i kompletní složení střevní mikroflóry u obou skupin zvířat pocházejících z chovů ve Švédsku, Dánsku, Francii a Itálii. Frekvence výskytu genů sul1, sul2, strA, tet(A), tet(B) a cat byla stanovena pomocí real-time PCR u 468 vzorků trusu odebraných z rekta poražených prasat. Diverzita střevní mikroflóry byla stanovena u 48 vybraných vzorků pyrosekvenováním V3/V4 variabilní oblasti genů pro 16S rRNA. Na rozdíl

Czech name

Kvantifikace genů antibiotické rezistence v mikrobiálních populacích trusu prasat z konvenčních a ekologických chovů

Czech description

Jedním ze současných trendů v zemědělství je oživení zájmu o ekologickou produkci. Zvýšený zájem o tuto problematiku souvisí zejména se zvýšeným zájmem o welfare hospodářských zvířat v ekologických chovech a naopak negativními dopady spojenými s vyšší spotřebou antibiotik v konvenčních chovech. Na druhou stranu, ekologická produkce je spojena se zvýšenou expozicí zvířat vnějšímu prostředí s potenciálními rezervoáry patogenů. V této práci jsme proto porovnali výskyt genů pro antibiotické rezistence ve střevní mikroflóře prasat z ekologických a konvenčních chovů. Navíc jsme porovnali i kompletní složení střevní mikroflóry u obou skupin zvířat pocházejících z chovů ve Švédsku, Dánsku, Francii a Itálii. Frekvence výskytu genů sul1, sul2, strA, tet(A), tet(B) a cat byla stanovena pomocí real-time PCR u 468 vzorků trusu odebraných z rekta poražených prasat. Diverzita střevní mikroflóry byla stanovena u 48 vybraných vzorků pyrosekvenováním V3/V4 variabilní oblasti genů pro 16S rRNA. Na rozdíl

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/ED0006%2F01%2F01" target="_blank" >ED0006/01/01: Center for Advanced Microbiology & Immunology Research in Veterinary Medicine</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2015

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Veterinářství

ISSN

0506-8231

e-ISSN

—

Volume of the periodical

65

Issue of the periodical within the volume

10

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

4

Pages from-to

784-787

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—